结论：农业农村局退伍军人安置的工人因交通肇事罪被判一缓二，能否保住公职，需视具体情况而定，主要取决于单位规章制度、是否被追究刑事责任以及是否符合开除公职的法定条件。
分析如下：
单位规章制度的影响：
- 不同单位对于员工犯罪后的处理方式可能有所不同。一些单位可能根据内部规章制度，对被判处刑罚的员工采取开除、辞退或其他纪律处分。因此，首先需要查阅农业农村局的相关规章制度，了解其对员工犯罪后的具体处理规定。
是否被追究刑事责任：
- 交通肇事罪属于刑事犯罪，一旦被判刑，即意味着被追究了刑事责任。根据《中华人民共和国公职人员政务处分法》的相关规定，公职人员因犯罪被单处罚金，或者犯罪情节轻微，人民检察院依法作出不起诉决定或者人民法院依法免予刑事处罚的，予以撤职；造成不良影响的，予以开除。但在此案例中，工人已被判刑（一缓二），即已构成被追究刑事责任。
是否符合开除公职的法定条件：
- 根据《中华人民共和国公职人员政务处分法》第十四条，公职人员犯罪，有下列情形之一的，予以开除：（一）因故意犯罪被判处管制、拘役或者有期徒刑以上刑罚（含宣告缓刑）的；（二）因过失犯罪被判处有期徒刑，刑期超过三年的；（三）因犯罪被单处或者并处剥夺政治权利的。在此案例中，工人因交通肇事罪（过失犯罪）被判一缓二，若该罪名及刑罚符合单位规章制度中规定的开除情形，或者根据公职人员政务处分法的相关规定，单位认为其情节严重、影响恶劣，也可能决定开除其公职。但需注意，并非所有过失犯罪被判缓刑的情况都会导致开除公职，这还需结合具体案情和单位规定来判断。
特殊身份与情节考量：
- 该工人为退伍军人，且是通过安置方式进入农业农村局工作的。这一特殊身份可能在单位处理时作为一定考量因素，但并非决定性因素。单位在处理时，仍会主要依据法律法规和内部规章制度来作出决定。
建议：
- 查阅单位规章制度：首先，建议该工人查阅农业农村局的相关规章制度，了解其对员工犯罪后的具体处理规定。
- 咨询单位人事部门：其次，可以咨询单位的人事部门或相关负责人，了解单位对此类情况的处理态度和流程。
- 寻求法律援助：若认为单位的处理决定存在不当之处，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
后续行动：
- 若单位决定开除公职，且该工人认为决定不当，可以在收到处分决定书之日起三十日内向处分决定机关申请复核；对复核结果不服的，可以自接到复核决定之日起三十日内，按照规定向处分决定机关的上一级机关提出申诉。
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