在法人离任审计阶段，子公司是可以进行变更的，但需根据具体情况判断变更的合法性和可行性，并确保符合相关法律法规及公司章程的规定。以下从不同角度对此问题进行分析：

一、法人离任审计的性质与目的

法人离任审计，通常是对即将离任的法定代表人或高级管理人员在其任职期间的经济责任、财务状况、业务运营等方面进行的全面审查。其目的在于评估离任者的管理绩效，确认其是否履行了应尽的职责，以及是否存在违法违规行为。这一审计过程本身并不直接限制子公司的变更行为，但审计结果可能对变更的决策产生影响。

二、子公司变更的法律依据与程序

子公司的变更，包括但不限于股权结构变更、经营范围变更、法定代表人变更等，均需依据《公司法》及相关法律法规进行。具体程序通常包括：

1. 内部决策程序：根据公司章程，子公司变更需经过股东会或董事会的决议。在法人离任审计阶段，若审计尚未完成，但变更事项已得到股东会或董事会的批准，且该变更不违反法律法规和公司章程的规定，则变更行为是合法的。
2. 外部审批程序：某些变更事项，如股权结构变更，可能还需经过相关政府部门的审批或备案。在此情况下，应确保在审计期间或审计完成后，及时办理相关手续，以满足法律法规的要求。

三、法人离任审计对子公司变更的影响

1. 审计结果对变更决策的影响：若审计结果显示离任者在管理期间存在严重问题，如财务违规、业务运营不当等，这可能影响股东会或董事会对子公司变更的决策。例如，若审计发现离任者存在挪用资金等违法行为，股东会或董事会可能会暂停或取消原定的变更计划。
2. 审计期间变更的谨慎性：在审计期间进行子公司变更，可能引发外界对变更动机的质疑。为避免不必要的争议和风险，建议在审计完成后再进行变更。若因特殊原因需在审计期间进行变更，应确保变更事项的合法性和合理性，并充分披露相关信息。

四、法律建议

1. 确保变更的合法性：在进行子公司变更前，应仔细审查相关法律法规和公司章程的规定，确保变更事项符合法律要求。
2. 充分披露信息：若在审计期间进行子公司变更，应向审计机构和相关方充分披露变更事项的背景、目的和影响，以消除外界的疑虑和误解。
3. 谨慎决策：在审计结果未明确前，应谨慎对待子公司变更事项。若审计结果显示存在严重问题，应暂停或取消变更计划，待问题解决后再行考虑。

总结来说，法人离任审计阶段子公司能否变更，需根据具体情况判断。在确保变更合法、合规且符合公司章程规定的前提下，可以进行变更。但为避免不必要的争议和风险，建议在审计完成后再进行变更。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。