结论前置：针对您描述的情况，对方欠款一万起诉后已立案，但对方已还五千，您可以从以下几个角度处理：一是继续诉讼要求对方偿还剩余五千元及可能的利息或违约金；二是与对方协商，看是否能就剩余款项达成新的还款协议；三是考虑撤诉，但需权衡撤诉成本与收益。以下是对各角度的详细分析：

1. 继续诉讼

   • 法律背景：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，一旦诉讼立案，原告有权要求被告履行全部债务。即使被告在诉讼过程中部分履行了债务，原告仍有权就剩余部分继续诉讼。
   • 操作建议：您可以继续推进诉讼程序，向法院提交对方已还款五千元的证据，并明确要求对方偿还剩余五千元及可能的利息或违约金（如果合同中有约定）。法院将根据双方提供的证据和法律规定作出判决。
   • 可能后果：如果法院支持您的诉求，对方将被判决偿还剩余款项，并可能需承担诉讼费用。如果对方不履行判决，您还可以申请强制执行。

2. 与对方协商

   • 法律背景：在诉讼过程中，双方有权进行和解或调解。如果双方能就剩余款项的偿还达成一致，可以签订和解协议或调解协议，并提交给法院确认。
   • 操作建议：您可以主动与对方联系，表达愿意就剩余款项进行协商的意愿。在协商过程中，您可以提出合理的还款计划或条件，如分期还款、减免部分利息等。如果双方能达成一致，可以签订书面协议并提交给法院。
   • 可能后果：如果双方能成功协商并达成一致，诉讼程序可能会因此终止或简化。这有助于节省时间和诉讼成本，同时也有助于维护双方的关系。

3. 考虑撤诉

   • 法律背景：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，原告在诉讼过程中有权申请撤诉。但撤诉需符合法律规定，且可能需承担一定的诉讼费用。
   • 操作建议：如果您认为继续诉讼的成本（如时间、精力、诉讼费用等）高于您期望获得的收益（即剩余五千元及可能的利息或违约金），您可以考虑申请撤诉。但在此之前，请务必权衡利弊并咨询专业律师的意见。
   • 可能后果：如果法院批准您的撤诉申请，诉讼程序将终止。但请注意，撤诉后您可能无法再就同一事实和理由再次起诉对方。因此，在决定撤诉前请务必谨慎考虑。

额外建议：无论您选择哪种方式处理此事，都建议您保留好所有与案件相关的证据和文件（如借款合同、还款记录、诉讼材料等）。这些证据和文件将有助于您在诉讼或协商过程中维护自己的权益。

最后，如果您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。