结论前置：公司以违规纪律为由不让员工加班，是否合理需分情况讨论，具体如下：

1. 若公司规章制度合法且员工确实违规：

   • 法律背景：根据《劳动合同法》及相关劳动法规，公司有权制定合理的规章制度来管理员工，包括加班管理。若这些规章制度不违反法律法规，且已向员工公示或告知，员工应当遵守。
   • 具体分析：如果员工确实违反了公司的规章制度，且这些规章制度中明确规定了违规行为的处理措施，包括限制加班等，那么公司以此为由不让员工加班，在法律上是合理的。但公司需确保处理措施与违规行为的性质、情节相适应，不得过度处罚。
   • 建议：员工应仔细审查公司的规章制度，确认自己是否存在违规行为。若确实存在，应接受公司的合理处理，并努力改正以避免类似情况再次发生。

2. 若公司规章制度不合法或员工未违规：

   • 法律背景：同样依据《劳动合同法》及相关劳动法规，公司的规章制度必须合法、合理，且不得侵犯员工的合法权益。若规章制度违法或未向员工公示、告知，则对员工不产生约束力。
   • 具体分析：如果公司的规章制度不合法，或者员工并未违反任何规章制度，而公司却以此为由不让员工加班，那么公司的行为可能构成违法。员工有权要求公司恢复其加班权利，并可能因此获得相应的法律救济。
   • 建议：员工应首先与公司沟通，要求公司说明不让加班的具体原因，并出示相关规章制度。若公司无法提供合法依据，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

3. 关于加班的额外法律考量：

   • 加班限制：根据《劳动法》的规定，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。
   • 加班工资：若公司安排员工加班，应按照法律规定支付加班工资。若公司未支付加班工资，员工同样有权要求公司支付，并可能因此获得法律救济。

进一步思考：在处理此类问题时，员工应保留好相关证据，如公司规章制度、违规通知、加班记录等，以便在需要时证明自己的权益。同时，员工也应了解自己的法律权益和维权途径，以便在权益受到侵害时及时采取行动。若遇到复杂情况或不确定如何处理时，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。