刑事案件的处罚判决由不同的机关根据案件性质和刑罚种类来具体负责，以下是对此问题的详细解答：

1. 侦查与起诉阶段：

   • 公安机关：负责刑事案件的立案侦查工作，收集证据，查明犯罪事实，并对犯罪嫌疑人采取必要的强制措施，如拘传、取保候审、监视居住、拘留、逮捕等。例如，在盗窃案中，公安机关会勘查现场，寻找指纹、监控录像等证据，并询问目击者。
   • 人民检察院：对公安机关提请批准逮捕的犯罪嫌疑人进行审查，决定是否批准逮捕；对公安机关侦查终结后移送起诉的案件进行审查，认为符合起诉条件的，向人民法院提起公诉。同时，人民检察院还对整个刑事诉讼活动进行法律监督，确保侦查、审判活动的合法性。

2. 审判阶段：

   • 人民法院：作为国家的审判机关，负责审理刑事案件并作出判决。法院会依法组成合议庭，开庭审理案件，听取公诉人、被告人及其辩护人的意见，审查证据，认定案件事实，并根据法律规定作出有罪或无罪的判决。例如，在故意伤害案件中，法院会根据查明的事实，判断被告人的行为是否构成故意伤害罪以及应判处的刑罚。

3. 刑罚执行阶段：

   • 死刑的执行：由人民法院负责执行，包括死刑立即执行和死刑缓期二年执行。死刑立即执行需依照法定程序在特定场所或指定地点进行；死刑缓期二年执行的罪犯，则由公安机关依法送交监狱执行刑罚。
   • 有期徒刑、无期徒刑及未成年犯的执行：由监狱（对于未成年犯为未成年犯管教所）负责执行。这些机构负责监管、教育和改造罪犯，通过组织劳动、思想教育等活动，促使他们改过自新。
   • 拘役的执行：由公安机关在拘役所、看守所等机构执行。拘役是短期剥夺犯罪分子人身自由并就近实行强制劳动改造的刑罚方法。
   • 剥夺政治权利的执行：独立适用时由人民法院执行；附加适用时，服刑期间由罪犯服刑单位或户口所在地的公安机关执行，刑满释放后仍需执行的，同样由罪犯原服刑单位或户口所在地的公安机关执行。
   • 罚金的执行：由人民法院负责执行。被判处罚金的罪犯需按照判决指定的期限缴纳罚金。若因遭遇不能抗拒的灾祸等原因导致缴纳确实有困难，经人民法院裁定，可以延期缴纳、酌情减少或者免除罚金。
   • 没收财产的执行：由人民法院负责执行，必要时可会同公安机关共同执行。没收财产是没收犯罪分子个人所有财产的一部或全部。
   • 社区矫正的执行：对被判处管制、宣告缓刑、假释或者暂予监外执行的罪犯，依法实行社区矫正。社区矫正机构会组织相关部门和社会力量，对罪犯进行监督管理、教育帮扶等活动，使其在不脱离社会的情况下接受改造，更好地回归社会。

综上所述，刑事案件的处罚判决是一个涉及多个国家机关协同合作的过程。从侦查、起诉到审判，再到刑罚执行，每个阶段都有明确的机关负责，确保判决得到准确、有效的执行。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。