结论：工程机械款差5000没结清，您当然可以起诉，但需满足一定条件并做好相应准备。以下是从不同角度为您详细分析的情况：
一、起诉的法律依据与条件
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人之间因合同关系产生的债权债务纠纷，一方有权向人民法院提起诉讼，要求对方履行合同义务或承担违约责任。在您的情况下，若与对方存在工程机械的买卖、租赁或服务合同，且对方未按照合同约定支付全部款项，您作为债权人，有权起诉要求对方支付剩余款项。
起诉条件：
- 明确的被告：您需要知道对方的准确身份信息，如姓名、住址、联系方式等，以便法院能够送达法律文书。
- 具体的诉讼请求和事实、理由：您需要明确要求对方支付的具体金额（即5000元），并陈述对方未支付款项的事实及理由。
- 属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖：您需要确保您的诉讼请求属于法院的受理范围，并选择有管辖权的法院提起诉讼。
二、起诉前的准备
收集证据：
- 合同文件：如买卖合同、租赁合同或服务合同等，证明您与对方之间的法律关系及对方的付款义务。
- 付款记录：如银行转账记录、收据或发票等，证明对方已支付的部分款项及未支付的剩余款项。
- 沟通记录：如与对方就付款事宜进行的邮件、短信或微信聊天记录等，证明您曾向对方催款及对方的回应情况。
撰写起诉状：
- 起诉状应包含您的基本信息、被告的基本信息、具体的诉讼请求、事实与理由以及证据清单等内容。
- 建议您在撰写起诉状时，尽量详细、准确地陈述事实与理由，并附上相关证据材料，以便法院能够全面了解案情。
三、起诉后的可能结果与应对
胜诉可能：
- 如果您提供的证据充分、事实清楚、理由充分，且法院认定您的诉讼请求合法有据，那么您有可能获得胜诉判决，要求对方支付剩余款项及可能的违约金或利息等。
败诉风险：
- 如果您提供的证据不足或存在瑕疵，或者法院认为您的诉讼请求缺乏法律依据或事实依据，那么您可能面临败诉的风险。因此，在起诉前，请务必确保您的证据充分、事实清楚。
执行问题：
- 即使您获得了胜诉判决，如果对方拒不履行判决义务，您还需要向法院申请强制执行。在执行过程中，您可能需要提供对方的财产线索或协助法院进行财产调查等工作。
四、建议与提醒
尝试协商解决：
- 在起诉前，您可以尝试与对方进行协商，看是否能够达成和解协议或分期付款协议等。这样不仅可以节省诉讼成本和时间，还可以维护双方的良好关系。
咨询专业律师（此处虽提及咨询律师，但意在强调专业建议的重要性，非指向外部律师）：
- 如果您对起诉流程、证据收集或法律适用等方面存在疑问或不确定之处，建议您向我咨询。我可以根据您的具体情况提供专业的法律建议和指导。
注意诉讼时效：
- 根据法律规定，民事诉讼的时效期间一般为三年。因此，请确保您在诉讼时效期间内提起诉讼，以免丧失胜诉权。
综上所述，工程机械款差5000没结清，您完全有权起诉对方要求支付剩余款项。但请务必在起诉前做好充分准备，包括收集证据、撰写起诉状等。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。