结论前置：在互殴导致轻伤二级且已取得对方谅解的情况下，检察院是否会提起公诉并非绝对，而是需要综合考量多种因素来决定。
一、可能不起诉的情况及法律依据
酌定不起诉：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
- 在互殴轻伤二级的案件中，如果犯罪嫌疑人一贯表现良好，犯罪行为动机不恶劣，手段不残忍，且真诚悔罪，通过赔偿损失、赔礼道歉等方式获得了被害人的谅解，检察机关可能会认为其社会危害程度较小，从而作出不予起诉的决定。
和解程序的应用：
- 《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百八十八条规定，下列公诉案件，犯罪嫌疑人、被告人真诚悔罪，通过向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，被害人自愿和解的，双方当事人可以和解：（一）因民间纠纷引起，涉嫌刑法分则第四章、第五章规定的犯罪案件，可能判处三年有期徒刑以下刑罚的；（二）除渎职犯罪以外的可能判处七年有期徒刑以下刑罚的过失犯罪案件。
- 若互殴轻伤二级案件属于上述情形之一，且双方达成了和解协议，检察机关在综合考量后，有可能作出不起诉决定。但需注意，犯罪嫌疑人、被告人在五年以内曾经故意犯罪的，不适用该和解程序。
二、仍可能起诉的情况及原因
犯罪情节严重：
- 如果犯罪情节严重，如犯罪手段恶劣、造成较大社会影响，或者犯罪嫌疑人存在累犯等不利情形，即使受害人谅解，检察机关也可能依法提起公诉。
公诉案件的性质：
- 轻伤二级案件一旦涉及刑法规畴，通常属于公诉案件。这意味着，即使被害方不告发，检察院也有权启动司法程序，对犯罪嫌疑人进行追诉。
三、法律后果及建议
法律后果：
- 即使获得谅解并有可能免于起诉，轻伤二级的犯罪嫌疑人仍可能面临其他法律后果，如行政处罚、民事赔偿等。
- 若案件进入审判阶段，法院在量刑时会综合考虑案件的各种因素，包括被害人的谅解情况，但判决结果并非一定会是缓刑或免予刑事处罚。
建议：
- 犯罪嫌疑人应积极配合调查，真诚悔罪，并尽可能通过赔偿、道歉等方式获得被害人的谅解，以争取从轻或免于刑事处罚的机会。
- 同时，也应了解并接受可能面临的法律后果，做好相应的准备和应对。可以寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益。
综上所述，互殴轻伤二级已谅解后，检察院是否起诉是一个复杂而谨慎的决策过程，涉及多个方面的综合考量。因此，犯罪嫌疑人和受害者都应充分了解相关法律规定和程序，以便做出合理的预期和决策。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。