结论：关于您提到的“故意伤害案件中律师费给了3000元，还要给百分之30”的问题，这30%的额外费用是否需要除掉医药费和律师费，主要取决于您与律师之间的委托合同约定。以下从不同角度为您详细分析：
一、合同约定优先
合同内容：首先，您需要查看与律师签订的委托合同，特别是关于律师费支付方式和比例的条款。如果合同中明确规定了除了基础律师费（如您提到的3000元）外，还需根据案件结果（如赔偿金额）支付一定比例（如30%）的额外费用，并且没有明确说明该比例是否需扣除医药费和律师费，那么通常应按照合同约定执行。
合同解释：如果合同条款存在模糊或不明确之处，您可以与律师进行协商，寻求双方都能接受的解释。在协商过程中，您可以提出自己的理解和期望，同时听取律师的意见，以达成共识。
二、额外费用的性质
风险代理：如果这30%的额外费用是基于案件结果（如赔偿金额）的风险代理费用，那么根据风险代理的常规做法，该费用通常是在案件胜诉或获得赔偿后，从赔偿金额中按比例提取的。在这种情况下，是否需要扣除医药费和律师费，应依据合同约定或双方协商确定。
非风险代理：如果这30%的额外费用并非基于案件结果，而是作为律师提供额外服务或努力的补偿，那么该费用通常应独立于医药费和基础律师费之外支付。
三、实际操作建议
审查合同：建议您首先仔细审查与律师签订的委托合同，特别是关于费用支付的条款，以明确双方的权利和义务。
与律师沟通：如果合同条款存在不明确或模糊之处，或者您对费用支付有疑问，建议您及时与律师进行沟通，寻求明确的解释和解决方案。
考虑法律后果：在支付任何费用之前，请确保您了解并接受该费用的性质和金额，以避免后续产生不必要的纠纷或法律风险。
四、示例说明
假设您与律师签订的委托合同中规定：基础律师费为3000元，如果案件胜诉并获得赔偿，您还需从赔偿金额中支付30%作为额外律师费。在这种情况下，如果赔偿金额为10000元，那么您需要支付的额外律师费为3000元（10000元 * 30%），该费用通常不会扣除医药费和基础律师费（除非合同另有约定）。
最后，如果您对律师费支付有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况和需求，为您提供全面、准确的法律建议。