刑事案件已经判决两年，在一般情况下是不能直接申请再审的，但在特定情形下，即使超过两年也可受理。以下是对此问题的详细分析：
一、一般原则
在刑事诉讼中，当事人及其法定代理人、近亲属对已经发生法律效力的判决、裁定提出申诉，通常应当在判决、裁定发生法律效力后两年内提出。这一规定旨在确保司法程序的及时性和稳定性，避免无限期地拖延诉讼进程。
二、特殊情形下的受理
尽管存在上述两年期限的一般规定，但在某些特殊情形下，即使超过两年提出申诉，法院也会予以受理。这些特殊情形包括：
可能对原审被告人宣告无罪：例如，出现了新的证据，这些证据足以证明原审被告人在犯罪事实上可能是清白的。随着科技的发展，新的鉴定技术可能揭示出与原审不同的结果，从而证明原审被告人无罪。
原审被告人在规定期限内曾提出申诉但未被受理：如果原审被告人在判决、裁定生效后的两年内已按照法定程序向法院提交了申诉材料，但因各种原因法院未予受理，那么即便两年期限已过，原审被告人再次申诉时，法院也应当受理。
属于疑难、复杂、重大案件：这类案件在事实认定、法律适用、证据采信等方面存在较大争议或复杂情况，如涉及多起犯罪事实、多个犯罪嫌疑人、证据种类繁多且相互矛盾的案件，或者在社会上引起广泛关注、具有重大影响的案件。
有新的证据证明原判决、裁定确有错误：在两年期限内或之后，如果发现新的证据能够证明原判决、裁定认定的事实确有错误，或者据以定罪量刑的证据不确实、不充分，主要证据之间存在矛盾且不能合理排除，以及原判决、裁定适用法律确有错误等情况，当事人仍然可以提出申诉。
三、其他特殊情况
除了上述规定的特殊情形外，如果是人民法院院长发现本院已经发生法律效力的判决和裁定确有错误，或者上级人民法院发现下级人民法院已经发生法律效力的判决和裁定确有错误，也可以不受两年期限的限制，启动审判监督程序进行再审。这体现了司法机关对错误裁判的自我纠正机制。
四、建议与行动
收集证据：如果您认为存在上述特殊情形，应尽快收集相关证据，如新的鉴定报告、证人证言等，以支持您的申诉请求。
咨询专业律师：在准备申诉材料前，建议您先向我咨询，我会根据您的具体情况，提供专业的法律意见和帮助，确保您的申诉材料符合法律要求。
提交申诉材料：在准备好申诉材料后，按照法定程序向法院提交申诉申请，并等待法院的受理和审查结果。
如果您有进一步的疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况，提供详细的法律解答和帮助。