结论：有执业药师证但医院不聘用，这一行为本身并不直接构成违法，是否违法需结合具体情形判断。以下从不同角度进行分析：

1. 医院招聘自主权与执业药师证的关系

   • 医院作为用人单位，在招聘时享有一定的自主权，这包括根据自身需求设定招聘条件。执业药师证是从事药学相关工作的专业资质证明，但医院在招聘时，可能更侧重于应聘者的临床经验、专业技能、学历背景以及是否与医院的发展需求相匹配。因此，即使应聘者持有执业药师证，如果医院认为其不符合其他招聘条件或岗位需求，也有权不聘用。

2. 是否存在就业歧视

   • 如果医院在招聘过程中，明确表示不聘用持有执业药师证的应聘者，且这种拒绝聘用的理由与岗位需求无关，而是基于某种不合理的偏见或歧视（如性别、年龄、地域等），那么这种行为可能构成就业歧视。然而，要证明医院存在就业歧视，需要应聘者提供充分的证据，如招聘公告、面试记录、拒绝聘用的理由说明等。

3. 特定岗位与执业药师证的要求

   • 在某些特定岗位，如医院的药剂科或临床药学部门，执业药师证可能是必要的或高度期望的资质。如果医院在这些岗位的招聘中，明确要求应聘者必须持有执业药师证，但应聘者虽然持有该证却因其他原因（如经验不足、技能不匹配等）未被聘用，那么这种不聘用行为是合法的。因为医院有权根据岗位需求设定合理的招聘条件。

4. 法律建议

   • 如果您认为医院的不聘用行为存在违法或不合理之处，首先可以尝试与医院进行沟通，了解不聘用的具体原因。如果沟通无果，且您认为医院的行为确实侵犯了您的合法权益（如就业歧视），您可以考虑向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
   • 同时，我也建议您在未来的求职过程中，更加关注招聘公告中的岗位要求和条件，确保自己符合应聘岗位的基本要求。此外，不断提升自己的专业技能和经验，增加自己的竞争力，也是提高求职成功率的有效途径。

总结：有执业药师证但医院不聘用，并不直接构成违法。是否违法需结合医院招聘的具体条件、岗位需求以及是否存在就业歧视等因素进行综合判断。如果您对此有疑问或认为自己的权益受到侵犯，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。