结论：每天工作12小时是否合法，需根据具体情况判断，包括是否符合法定工时、是否支付加班费、是否经过劳动者同意以及是否存在特殊工时制度等因素。以下从不同角度详细分析：
一、法定工时与加班规定
根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。若用人单位安排劳动者每日工作12小时，显然超出了法定工时。然而，这并不意味着所有每日工作12小时的情况都违法，关键在于是否符合加班的相关规定。
加班时间限制：根据《劳动法》第四十一条，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。因此，若每日工作12小时，且未经过协商或超出法定加班时间限制，则属于违法行为。
加班费支付：即使符合加班时间限制，用人单位还需按照《劳动法》第四十四条的规定支付加班费。具体标准为：工作日加班支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；休息日加班且不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；法定休假日加班的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。若用人单位未支付加班费，即使工作时间未超出法定限制，也可能构成违法。
二、特殊工时制度
在某些特殊行业或岗位，如交通运输、旅游、医疗等，可能实行不定时工作制或综合计算工时工作制。这些特殊工时制度需经劳动行政部门批准，并明确适用岗位和劳动者范围。
不定时工作制：指因生产特点、工作特殊需要或职责范围的关系，无法按标准工作时间衡量或需要机动作业的职工所采用的一种工时制度。在不定时工作制下，劳动者的工作时间不受每日八小时的限制，但平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。若实行不定时工作制且已获批准，每日工作12小时可能合法，但需确保劳动者平均工作时间符合法定标准。
综合计算工时工作制：指分别以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间，但其平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。在综合计算工时工作制下，若一个周期内总工作时间未超出法定标准，即使某日工作12小时，也可能合法。但同样需确保劳动者平均工作时间符合法定标准，并支付相应的加班费。
三、劳动者同意与协商
即使符合加班时间限制和特殊工时制度，用人单位还需与劳动者进行协商，并取得劳动者的同意。若未经劳动者同意，强行安排每日工作12小时，即使符合其他条件，也可能构成违法。
四、法律建议
对于劳动者：若发现用人单位安排的工作时间超出法定限制或未支付加班费，可先与用人单位协商解决。若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
对于用人单位：应严格遵守法定工时和加班规定，确保劳动者的工作时间合法合规。若需实行特殊工时制度，应提前向劳动行政部门申请批准，并明确告知劳动者适用岗位和工作时间安排。同时，应按时足额支付加班费，避免引发劳动纠纷。
总之，每天工作12小时是否合法需根据具体情况判断。若您对此有疑问或遇到相关纠纷，可直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。