对于在政府采购相关办法实施前已签订的超过三年期限的合同，通常遵循“法不溯及既往”原则，即该办法一般不对其实施前的合同产生约束力，合同可继续履行至约定期限。以下从不同角度进行详细分析：

1. “法不溯及既往”原则的适用

   • 法律的基本原则之一是“法不溯及既往”，这意味着新的法律、法规或规章通常不会对其生效前已经发生的行为或签订的合同产生约束力。因此，如果政府采购的相关办法是在合同签订之后实施的，那么该办法中关于合同期限的规定一般不会影响到之前已经签订的合同。
   • 在这种情况下，已经签订的超过三年期限的合同应当继续履行，直到合同约定的期限届满。这是因为合同双方在签订合同时，是基于当时的法律环境和合同条款达成一致的，新的规定不应改变这一已经形成的法律关系。

2. 合同继续履行的条件

   • 尽管合同可以继续履行，但也需要满足一定的条件。首先，合同的内容必须合法，即不违反当时有效的法律、法规或规章。如果合同内容存在违法之处，那么即使是在新办法实施前签订的，也可能面临被认定无效或部分无效的风险。
   • 其次，合同的履行不得损害国家利益、社会公共利益或他人合法权益。如果合同的履行会导致这些不利后果，那么相关部门或单位有权采取措施进行干预，包括但不限于终止合同、要求修改合同条款等。

3. 特殊情况下的处理

   • 在某些特殊情况下，即使合同是在新办法实施前签订的，也可能需要受到新办法的调整。例如，如果新办法明确规定了对于之前签订的合同也适用某些条款，或者合同双方在新办法实施后自愿协商一致对合同进行修改以符合新办法的要求，那么这些情况下合同可能会受到新办法的影响。
   • 此外，如果合同履行过程中出现了不可抗力、情势变更等法定情形，导致合同无法继续履行或履行变得显失公平，那么合同双方也可以根据法律规定或合同约定进行协商，寻求合理的解决方案。

建议：对于已经签订的超过三年期限的政府采购合同，建议合同双方密切关注相关法律法规的变化，确保合同的履行符合最新的法律要求。如果合同履行过程中遇到任何问题或争议，可以及时咨询专业律师或相关机构以获取帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我提问。