在变更公司登记的情境下，通常应起诉总公司，而非分公司，但具体需根据变更事项及分公司是否具有独立法人资格来综合判断。以下从不同角度进行分析：

一、分公司不具有独立法人资格的情况

1. 法律地位：分公司作为总公司的分支机构，不具有独立的法人资格，其民事责任由总公司承担。因此，在涉及公司登记变更等事项时，分公司本身无法作为独立的法律主体进行诉讼。
2. 诉讼主体：若因分公司的原因（如未按规定办理变更登记）导致需要变更公司登记，且分公司无法独立承担责任时，应起诉总公司。总公司作为分公司的设立者和责任承担者，有义务确保分公司的登记事项符合法律法规要求。

二、分公司具有独立法人资格的情况（虽不常见，但需考虑）

1. 特殊情形：在极少数情况下，分公司可能因特定原因（如法律、法规的特别规定或总公司的特别授权）被赋予独立法人资格。然而，在大多数国家和地区，分公司通常不具有独立法人资格。
2. 诉讼主体：若分公司确实具有独立法人资格，且因自身原因需要变更登记，理论上可以起诉分公司。但这种情况较为罕见，且需具体分析相关法律法规和合同条款。

三、实际操作建议

1. 核实分公司资格：在决定起诉前，应首先核实分公司是否具有独立法人资格。这通常可以通过查阅公司章程、营业执照等文件来确认。
2. 明确变更事项：确定需要变更的具体登记事项（如公司名称、住所、法定代表人等），以及变更的原因和责任方。
3. 选择诉讼对象：根据分公司是否具有独立法人资格以及变更事项的具体情况，选择起诉总公司或分公司（若分公司具有独立法人资格）。在大多数情况下，起诉总公司是更为稳妥的选择。
4. 收集证据：在起诉前，应收集充分的证据来支持自己的主张，包括但不限于合同、协议、变更登记申请书、相关部门的批复文件等。

四、法律后果

1. 若起诉总公司：若法院判决总公司承担变更登记的责任，总公司需按照判决要求办理变更登记手续，并可能承担因未及时变更而产生的法律责任（如罚款、赔偿等）。
2. 若起诉分公司（若具有独立法人资格）：若法院判决分公司承担变更登记的责任，分公司需按照判决要求办理变更登记手续，并可能承担相应的法律责任。但如前所述，这种情况较为罕见。

综上所述，在变更公司登记的情境下，通常应起诉总公司。然而，具体选择起诉对象还需根据分公司是否具有独立法人资格以及变更事项的具体情况来综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。