核心结论：投标文件合同章没盖在指定位置，可能面临投标文件被认定为无效、需承担相应法律责任等后果，但可通过及时沟通补救、依据实际情况抗辩等方式来应对，具体如下：
- 可能面临的后果
- 投标文件被认定为无效：在招投标活动中，招标文件通常会明确规定投标文件的格式、签署要求等各项细节，其中合同章的盖章位置往往也是重要要求之一。如果合同章没有盖在指定位置，可能被视为未按照招标文件的要求编制投标文件，根据《中华人民共和国招标投标法》等相关法律法规，招标人有权将该投标文件认定为无效投标。例如，在一些大型工程项目的招标中，对于投标文件的盖章位置、签字要求等都有非常严格的规定，一旦不符合要求，就可能导致投标被否决。
- 承担相应法律责任：如果因为合同章未盖在指定位置而影响了招投标活动的正常进行，给招标人或者其他投标人造成了损失，投标人可能需要承担相应的法律责任。这种责任可能包括民事赔偿责任，即赔偿因投标无效给招标人造成的重新招标费用、工期延误损失等；在严重的情况下，如果存在串通投标、弄虚作假等违法行为，还可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得、吊销营业执照等。
- 应对措施
- 及时与招标人沟通补救：在发现合同章未盖在指定位置后，投标人应第一时间与招标人取得联系，说明情况并请求给予补救的机会。例如，可以提出重新提交盖章正确的投标文件，或者以书面形式向招标人说明盖章位置偏差的原因，并承诺该偏差不会影响投标文件的真实性和有效性。如果招标人同意补救，投标人应按照招标人的要求及时完成补救措施，以确保投标文件的有效性。
- 依据实际情况进行抗辩：如果招标人坚持认定投标文件无效，投标人可以根据实际情况进行抗辩。例如，如果合同章虽然未盖在指定位置，但不影响投标文件的整体内容和实质性要求，且能够证明该偏差是由于疏忽或者其他合理原因造成的，投标人可以向招标人提供相关证据，争取让招标人改变决定。此外，如果招标文件对于盖章位置的要求存在模糊不清或者不合理的情况，投标人也可以以此为依据进行抗辩，要求招标人重新审视投标文件的有效性。
- 寻求法律途径解决争议：如果与招标人的沟通协商无法解决问题，投标人可以考虑通过法律途径解决争议。可以向相关的行政监督部门投诉，请求其对招投标活动进行监督和审查；也可以根据招标文件中的争议解决条款，向仲裁机构申请仲裁或者向人民法院提起诉讼，通过法律程序维护自己的合法权益。
在实际操作中，为了避免合同章未盖在指定位置等问题带来的风险，投标人在编制投标文件时应严格按照招标文件的要求进行操作，仔细核对每一项细节，确保投标文件的完整性和合规性。如果你在招投标过程中遇到其他法律问题，欢迎随时向我咨询。