买卖合同纠纷起诉后，一审法院以合同纠纷作出判决通常是合法的。以下从几个方面进行详细分析：
一、法律关系的定性
在民事诉讼中，法院对案件的定性是基于当事人之间的法律关系。买卖合同纠纷，本质上属于合同纠纷的一种。当双方因买卖合同的履行、解释、效力等问题产生争议，并诉诸法院时，法院会根据双方提交的证据和法律规定，对案件进行审理，并作出相应的判决。因此，将买卖合同纠纷定性为合同纠纷，并据此作出判决，是符合法律规定的。
二、法院的管辖与审理
管辖：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，合同纠纷案件通常由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。在买卖合同纠纷中，如果双方没有约定管辖法院，那么原告可以选择向被告住所地或者合同履行地的人民法院提起诉讼。法院在受理案件后，会依法进行审理。
审理：法院在审理买卖合同纠纷案件时，会依据《中华人民共和国民法典》中关于合同的规定，以及双方签订的买卖合同的具体条款，对案件进行全面、客观的审查。法院会听取双方的陈述和辩论，审查双方提交的证据，并根据法律规定和案件事实，作出公正的判决。
三、判决的合法性与合理性
合法性：法院作出的判决，必须基于法律规定和案件事实。在买卖合同纠纷案件中，如果法院认定双方存在合同关系，且合同内容合法有效，那么法院就有权根据合同约定和法律规定，对双方的权利义务进行裁决。因此，以合同纠纷作出判决，是合法的。
合理性：除了合法性外，判决的合理性也是衡量其质量的重要标准。在买卖合同纠纷案件中，法院会综合考虑双方的经济状况、合同履行情况、过错程度等因素，作出公平合理的判决。这样的判决，既能够维护当事人的合法权益，又能够促进社会经济的和谐稳定。
四、特殊情况下的处理
虽然买卖合同纠纷通常会被定性为合同纠纷，并据此作出判决，但在某些特殊情况下，法院也可能会根据案件的具体情况，对案件进行不同的定性或处理。例如，如果买卖合同中涉及欺诈、胁迫等违法行为，那么法院可能会将案件定性为侵权纠纷或其他类型的纠纷，并据此作出相应的判决。然而，这种情况并不改变买卖合同纠纷本质上属于合同纠纷的事实，只是法院在审理过程中，根据案件的具体情况，对法律关系进行了更为细致的划分和处理。
总结与建议：
买卖合同纠纷起诉后，一审法院以合同纠纷作出判决，通常是合法且合理的。当然，如果对判决结果有异议，可以在法定期限内提起上诉，通过二审程序来维护自己的合法权益。如果你在买卖合同纠纷中遇到了法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议。