结论：在肇事逃逸致人重伤二级且检察院不起诉的情况下，交警队仍有权根据具体情况采取一系列措施，包括但不限于行政处罚、继续调查取证以及配合其他机关工作。
详细分析：
行政处罚权：
- 交警队作为交通管理机关，对于交通违法行为具有行政处罚权。在肇事逃逸的情况下，即使检察院决定不起诉，交警队仍可以根据《中华人民共和国道路交通安全法》等相关法律法规，对逃逸者进行行政处罚，如罚款、吊销驾驶证等。这是因为行政处罚与刑事处罚是两种不同的法律责任，检察院的不起诉决定并不影响交警队行使行政处罚权。
继续调查取证权：
- 交警队在处理交通事故时，有责任进行调查取证，以查明事故原因、确定责任归属。在肇事逃逸的情况下，交警队可能会继续调查逃逸者的身份、逃逸路线、事故经过等关键信息，以便为后续的行政处罚或可能的刑事追诉提供证据。即使检察院决定不起诉，交警队仍可以保留这些证据，并在需要时提供给其他机关或部门。
配合其他机关工作：
- 在肇事逃逸案件中，交警队可能需要与其他机关如公安机关、检察机关等密切合作。例如，交警队可能将调查取证的结果提供给公安机关，以便其进行进一步的侦查工作；或者配合检察机关对案件进行复查、复核等。此外，如果逃逸者涉及其他违法行为或犯罪行为，交警队也有义务将这些信息及时通报给相关机关。
特殊情况说明：
- 如果检察院不起诉的决定是基于证据不足或事实不清等原因，且交警队在后续调查中发现了新的证据或事实，那么交警队有权将这些新情况通报给检察机关，并建议其重新审查案件。
- 另外，如果逃逸者在逃逸过程中还造成了其他严重后果或涉及其他违法行为，交警队也有权根据相关法律法规对其进行相应的处理。
建议与提醒：
- 对于肇事逃逸者而言，即使检察院决定不起诉，也不意味着可以逃避法律责任。交警队仍可能对其进行行政处罚，并保留进一步追究其法律责任的权利。
- 对于受害者而言，如果检察院决定不起诉，但认为逃逸者的行为仍然构成违法或犯罪，可以向交警队或其他相关机关提出申诉或控告，要求依法处理。
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