结论概述：团体意外险的赔付通常不能直接抵扣用人单位应承担的工伤赔偿。这两者性质不同，分别基于不同的法律关系和合同约定，因此一般不能相互替代或抵扣。
详细分析：
团体意外险与工伤赔偿的性质差异：
- 团体意外险：这是一种商业保险，由用人单位为员工购买，旨在为员工在遭受意外伤害时提供一定的经济保障。其赔付范围和标准通常依据保险合同的约定。
- 工伤赔偿：这是基于《工伤保险条例》等法律法规的规定，当员工在工作过程中遭受事故伤害或患职业病时，用人单位应承担的赔偿责任。工伤赔偿的范围和标准由法律法规明确规定，具有强制性。
法律关系的不同：
- 团体意外险的赔付是基于保险合同关系，即员工与保险公司之间的合同关系。
- 工伤赔偿则是基于劳动关系，即员工与用人单位之间的法律关系。
赔付的独立性：
- 由于团体意外险和工伤赔偿分别基于不同的法律关系和合同约定，因此它们的赔付是独立的。即，员工获得团体意外险的赔付后，仍然有权根据法律法规的规定向用人单位主张工伤赔偿。
特殊情况下的处理：
- 在某些特殊情况下，如果保险合同中有特别约定，或者用人单位与员工之间有特别协议，可能会涉及团体意外险赔付与工伤赔偿之间的某种协调或抵扣。但这种情况需要具体分析合同条款和协议内容，且通常不会改变两者独立赔付的基本原则。
法律建议：
- 对于农民工而言，如果已经获得了团体意外险的赔付，但仍然认为用人单位应承担工伤赔偿责任，可以向用人单位提出主张，并依据《工伤保险条例》等法律法规的规定，要求用人单位进行工伤赔偿。
- 如果用人单位拒绝承担工伤赔偿责任，农民工可以向当地劳动保障行政部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果农民工能够证明自己遭受的伤害属于工伤范畴，且用人单位未依法为其缴纳工伤保险费或拒绝承担工伤赔偿责任，那么农民工有权要求用人单位按照法律法规的规定进行赔偿。
- 如果用人单位仍然拒绝赔偿，农民工可以通过法律途径追究用人单位的法律责任，并可能获得相应的赔偿金和补偿金。
综上所述，团体意外险的赔付通常不能直接抵扣用人单位应承担的工伤赔偿。农民工在获得团体意外险赔付后，仍然有权向用人单位主张工伤赔偿。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。