针对您提出的“虚开增值税发票税款48000元公安机关如何定罪处罚”的问题，以下是我根据相关法律法规及司法实践给出的详细解答：

一、定罪依据

虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票，均构成犯罪，这一行为主要依据《中华人民共和国刑法》第二百零五条进行定罪。该条款明确规定了虚开增值税专用发票、用于骗取出口退税、抵扣税款发票罪的相关内容，包括犯罪的定义、行为表现以及定罪标准。

二、定罪标准与量刑档次

1. 基本量刑档次：

   • 虚开税款数额在五万元以上的，应予立案追诉。虽然您提到的税款数额为48000元，未直接达到五万元的立案标准，但需注意，司法实践中可能还会考虑其他因素，如虚开的具体手段、造成的国家税收损失情况等，来综合判断是否构成犯罪。不过，若仅从数额上看，此数额接近但未达立案标准，可能不直接构成该罪的基本量刑档次，但若存在其他严重情节，仍可能被追诉。
   • 若虚开税款数额较大（一般为50万元以上）或者有其他严重情节的，将处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金。
   • 若虚开的税款数额巨大（一般为250万元以上）或者有其他特别严重情节的，将处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金或者没收财产。

2. 针对您情况的特别说明：

   • 您提到的税款数额为48000元，虽未直接达到“数额较大”或“数额巨大”的标准，但虚开增值税发票的行为本身具有严重的社会危害性，且可能伴随其他严重情节。因此，具体是否构成犯罪及量刑，还需由司法机关根据案件的具体情况，如虚开的手段、目的、造成的后果等，进行综合判断。

三、单位犯罪的处罚

若虚开增值税发票的行为是由单位实施的，那么除了对单位判处罚金外，还会对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，根据虚开税款数额和情节严重程度，分别处以相应的刑罚。

四、综合考量因素

在司法实践中，具体的定罪量刑会综合考虑多种因素，包括但不限于犯罪嫌疑人的主观故意、虚开的具体手段、造成的国家税收损失情况、是否有自首、立功、坦白等从轻、减轻处罚情节，以及是否存在其他严重情节等。

五、建议

鉴于虚开增值税发票行为的严重性和复杂性，我建议您或相关当事人尽快咨询当地专业律师，以便更准确地了解案件的法律性质、可能面临的法律后果以及应对策略。同时，也提醒所有单位和个人在税务处理中务必遵守相关法律法规，确保税务申报的真实性和合法性，以避免不必要的法律风险。