有违纪线索的情况下，您确实有权辞职，但具体操作和后续影响需视情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、辞职的合法性
劳动者辞职权：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者享有提前通知解除劳动合同的权利。一般情况下，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。在试用期内，劳动者提前三日通知用人单位，也可以解除劳动合同。因此，无论是否存在违纪线索，您都有权依法辞职。
违纪线索与辞职的关系：违纪线索本身并不构成您辞职的障碍。然而，如果您掌握的违纪线索涉及用人单位或其工作人员的违法行为，且您认为继续工作可能会对您造成不利影响（如被报复、牵连等），您可以选择辞职以保护自身权益。但请注意，辞职并不意味着您对违纪线索的揭露或举报义务的免除。
二、辞职后的可能影响
对违纪线索处理的影响：如果您在辞职前未向相关部门或机构揭露或举报违纪线索，辞职后您仍然可以选择揭露或举报。但请注意，辞职后您可能不再直接了解用人单位的内部情况，这可能会对您提供证据或信息造成一定困难。
对劳动关系的影响：辞职后，您与用人单位的劳动关系即行终止。如果您因违纪线索问题与用人单位产生纠纷（如用人单位认为您泄露机密、违反竞业限制等），您可能需要通过法律途径解决。在此情况下，您应保留好相关证据，以便在必要时维护自己的合法权益。
三、建议与注意事项
保留证据：在辞职前，如果您掌握违纪线索，建议您尽可能保留相关证据（如聊天记录、邮件、文件等）。这些证据可能在您后续揭露或举报违纪行为时发挥重要作用。
合法合规操作：在辞职过程中，您应确保自己的行为合法合规。例如，按照法律规定提前通知用人单位、办理工作交接等。避免因操作不当而引发不必要的法律纠纷。
寻求法律帮助：如果您对辞职后的法律后果或如何处理违纪线索存在疑问，建议您咨询专业律师。律师可以根据您的具体情况提供针对性的法律建议和帮助。
总结来说，有违纪线索并不妨碍您依法辞职。但在辞职前，您应充分考虑违纪线索可能对您和用人单位产生的影响，并采取相应的措施保护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。