交通事故肇事方垫付的医药费过了举证期限在庭审时再提交，是否还有作用，这需分情况讨论：
若对方同意质证：
- 在庭审过程中，如果对方（即受害方或其代理人）同意对逾期提交的医药费证据进行质证，那么这份证据仍然有可能被法庭采纳。因为质证是法庭审理案件的重要环节，它允许双方对证据的真实性、合法性、关联性进行辩论和确认。如果对方同意质证，就意味着他们认可了这份证据的提交和审查程序，法庭在综合考虑其他因素后，可能会将其作为认定案件事实的依据。
若对方不同意质证，但法庭认为有必要采纳：
- 如果对方不同意对逾期提交的医药费证据进行质证，法庭并不会直接排除这份证据。根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》等相关法律法规，法庭在特定情况下，如证据与案件基本事实有关、逾期提交证据有正当理由等，仍然有权决定采纳这份证据。当然，法庭在作出这一决定时，会充分考虑对方当事人的意见，并可能要求提交证据的一方说明逾期提交的原因和必要性。
若法庭不采纳逾期提交的证据：
- 如果法庭认为逾期提交的医药费证据不符合采纳的条件，或者对方当事人的异议成立，那么这份证据可能不会被法庭采纳。在这种情况下，肇事方可能会面临因证据不足而无法证明其垫付医药费的事实，进而可能影响其赔偿责任的承担。不过，这并不意味着肇事方就完全失去了追偿的权利。如果肇事方有充分的证据证明其确实垫付了医药费，并且这些费用是合理且必要的，那么他们仍然可以通过其他途径（如另行起诉等）来维护自己的权益。
法律建议：
- 及时提交证据：为了避免因逾期提交证据而带来的不必要的麻烦和风险，肇事方在交通事故发生后，应尽快收集并整理相关证据，包括医药费发票、诊断证明、用药清单等，并在规定的举证期限内提交给法庭。
- 与对方沟通协商：如果因特殊原因确实无法在举证期限内提交证据，肇事方应尽快与对方沟通协商，说明情况并请求对方同意延期提交或进行质证。这有助于增进双方的理解和信任，为案件的顺利解决创造有利条件。
- 咨询专业律师：在处理交通事故赔偿案件时，肇事方应咨询专业律师的意见和建议。律师可以根据案件的具体情况和相关法律法规，为肇事方提供全面的法律分析和策略建议，帮助他们更好地维护自己的合法权益。
总之，交通事故肇事方垫付的医药费过了举证期限在庭审时再提交，其作用取决于多种因素。为了确保自己的权益得到充分保障，肇事方应尽可能在规定的期限内提交证据，并在必要时咨询专业律师的意见。