挂靠公司虚开发票属于严重的违法行为，需立即停止并采取补救措施，同时可能面临行政处罚与刑事责任，具体处理方式需根据虚开情节的严重程度分情况讨论：

1. 若虚开发票行为尚未被税务机关或公安机关发现

• 立即停止虚开行为：挂靠方与被挂靠方均需立即停止虚开发票的违法行为，避免损失扩大。
• 自查整改：
  • 梳理已虚开的发票，统计金额、数量及涉及交易的真实性；
  • 若存在真实交易但发票开具不规范（如金额、税率错误），可主动联系税务机关更正；
  • 若无真实交易，需销毁或作废虚开发票，并调整相关账目。
• 主动向税务机关坦白：
  • 根据《税收征收管理法》第六十三条，纳税人偷税的，由税务机关追缴税款、滞纳金，并处不缴或少缴税款50%至5倍的罚款；
  • 主动坦白可争取从轻或减轻处罚，甚至可能免于刑事处罚（根据《刑法》第二百零一条第四款，有重大立功表现的可减轻或免除处罚）。

2. 若虚开发票行为已被税务机关或公安机关立案调查

• 配合调查：
  • 挂靠方与被挂靠方均需积极配合税务机关或公安机关的调查，如实提供账目、合同、资金流水等证据；
  • 避免隐匿、销毁证据或串供，否则可能构成妨碍公务罪或帮助毁灭证据罪。
• 委托律师介入：
  • 虚开发票罪（刑法第二百零五条）的立案标准为虚开税款数额1万元以上或致使国家税款被骗取5000元以上；
  • 律师可协助分析虚开情节的严重程度（如是否为首次虚开、虚开金额、是否造成税款损失等），制定辩护策略；
  • 若虚开金额较小或情节轻微，可争取不起诉或缓刑；若金额巨大或情节严重，需争取从轻处罚（如自首、立功、认罪认罚等）。

3. 法律责任分析

• 行政责任：
  • 虚开发票的，由税务机关没收违法所得；虚开金额在1万元以下的，可并处5万元以下罚款；虚开金额超过1万元的，并处5万元至50万元罚款；
  • 构成犯罪的，依法追究刑事责任后，仍需补缴税款、滞纳金及罚款。
• 刑事责任：
  • 虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，处三年以下有期徒刑或拘役，并处二万元至二十万元罚金；
  • 虚开税款数额较大（10万元以上）或有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元至五十万元罚金；
  • 虚开税款数额巨大（50万元以上）或有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或无期徒刑，并处五万元至五十万元罚金或没收财产。

4. 预防措施

• 完善内部管理：
  • 挂靠方与被挂靠方需签订书面协议，明确双方权利义务，禁止虚开发票；
  • 建立发票审核机制，确保每张发票均有真实交易背景。
• 定期税务合规培训：
  • 组织财务人员学习税法及发票管理规定，避免因无知或疏忽导致虚开。
• 咨询专业律师：
  • 在涉及复杂交易或税务筹划时，提前咨询律师，确保合法合规。

若您或您的公司涉及虚开发票问题，可直接向我咨询，我将根据具体情节为您提供详细法律意见。