在分包合同无效的情况下，公司收取的管理费通常是不应当被支持的，一般需要退回。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国民法典》第一百五十七条：
- 民事法律行为无效、被撤销或者确定不发生效力后，行为人因该行为取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方由此所受到的损失；各方都有过错的，应当各自承担相应的责任。法律另有规定的，依照其规定。
《中华人民共和国建筑法》第二十八条：
- 禁止承包单位将其承包的全部建筑工程转包给他人，禁止承包单位将其承包的全部建筑工程肢解以后以分包的名义分别转包给他人。这一条款明确了转包行为的违法性，而分包合同若存在转包情形，同样可能因此无效。
《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第一条及第四十三条：
- 认定了转包、违法分包等情形下建设工程施工合同的无效性，并规定了相关责任的承担方式。虽然这些条款未直接提及管理费，但明确了转包合同的无效性，为管理费的处理提供了法律基础。
二、管理费不应收取的原因
合同无效导致约定无效：
- 由于分包合同（若存在转包情形）本身无效，合同中关于管理费的约定也自然无效。因此，基于无效合同而主张的管理费缺乏合法依据，公司应当退回已收取的管理费。
管理费性质与法律规定不符：
- 管理费通常被视为转包人因组织和管理工程而收取的费用。然而，在转包行为中，这种“管理”往往并不符合法律规定的正当性要求。转包行为本身违反了法律的强制性规定，因此与之相关的管理费也不应得到支持。
避免不当得利：
- 如果允许公司在合同无效的情况下仍然收取管理费，将导致其获得不当利益。这不仅违背了公平原则，也可能鼓励更多的转包行为发生，从而扰乱建筑市场秩序。
三、实际操作中的考虑
- 证据保留：在处理此类纠纷时，务必保留好所有相关证据，如合同文本、沟通记录、交易凭证等。这些证据将有助于证明合同无效的事实以及管理费的收取情况。
- 法律途径：若公司拒绝退回管理费，可以通过法律途径来维护自己的合法权益。可以依据相关法律规定，向人民法院提起诉讼或申请仲裁，要求公司退回已收取的管理费。
建议：在处理分包合同无效及管理费退回问题时，建议根据具体情况咨询专业律师（即向我咨询），以便更准确地把握法律条款和司法实践中的具体操作。同时，也应注意保留好所有相关证据，以便在需要时提供有力的支持。