针对您提出的“学校污水纳管超标怎么处罚”的问题，这确实是一个涉及环境保护和法律法规的重要议题。以下是我根据相关法律法规和实际案例，为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，学校作为纳管企业（即向污水集中处理设施排放污水的企事业单位）之一，如果其排放的污水超标，将面临相应的法律处罚。这一处罚过程主要依据《中华人民共和国水污染防治法》以及《城镇排水与污水处理条例》等相关法律法规进行。
一、处罚的法律依据
《水污染防治法》：该法明确规定了向污水集中处理设施排放工业废水的，应当按照国家有关规定进行预处理，达到集中处理设施处理工艺要求后方可排放。如果违反这一规定，生态环境主管部门有权进行处罚。
《城镇排水与污水处理条例》：该条例也强调了运营单位（即污水处理厂）应当保证出水水质符合国家和地方规定的排放标准，同时规定了纳管企业的责任和义务，包括不得排放不达标污水等。
二、处罚的具体措施
立案调查：一旦发现学校污水纳管超标，生态环境主管部门将依法进行立案调查，收集相关证据，包括水质检测报告、排放记录等。
认定违法行为：根据调查结果，生态环境主管部门将认定学校的违法行为是否构成超标排放水污染物，或者是否属于“未按照规定进行预处理，向污水集中处理设施排放不符合处理工艺要求的工业废水”。在实际操作中，更倾向于依据后者进行立案调查处理，因为这更具体地针对了向污水集中处理设施排放废水的企业。
处罚决定：根据违法行为的性质和情节，生态环境主管部门将作出相应的处罚决定。处罚措施可能包括罚款、责令改正、限制生产或停产整治等。对于情节严重的违法行为，还可能面临更严厉的处罚，如吊销排污许可证等。
三、排放标准的适用
在处罚过程中，排放标准的适用也是一个关键问题。对于学校这类纳管企业，其排放的污水应当符合国家或地方规定的排放标准。如果学校所属行业有特定的污水排放标准（如制革及毛皮加工工业水污染物排放标准），则应当优先适用该行业标准进行衡量认定。
四、实际案例参考
在实际操作中，已有多个环境执法部门依据《水污染防治法》第八十三条第四项对类似违法行为进行了处罚。例如，余姚市环境保护局、淄博市生态环境局沂源分局、宁海县环境保护局等都曾处理过类似案件，并对违法企业进行了相应的处罚。
五、建议与措施
为了避免污水纳管超标问题的发生，学校应当加强内部管理，确保污水排放符合相关标准。同时，建议学校定期与污水处理厂进行沟通协调，了解污水处理厂的进水水质要求和处理工艺，以便及时调整自身的污水排放策略。此外，学校还可以积极寻求专业的环保咨询和服务，以提高自身的环保意识和能力。
综上所述，学校污水纳管超标将面临严厉的法律处罚。为了遵守相关法律法规并保护环境，学校应当加强内部管理、定期与污水处理厂沟通协调，并积极寻求专业的环保咨询和服务。