结论概述：商户交不起租金让主人（此处应理解为房东）入股，这一行为本身并不直接违法，但具体是否合法及可行，需根据双方协商一致的情况、入股协议的具体内容以及是否符合相关法律法规的规定来判断。

详细分析：

1. 协商一致原则：

   • 在商业活动中，双方当事人有权在平等、自愿的基础上，就任何事项进行协商并达成一致。因此，如果商户与房东就租金支付方式达成变更协议，即商户以让房东入股的方式替代租金支付，且这一变更协议是双方真实意思的表示，没有违反法律法规的强制性规定，那么这一行为是合法的。

2. 入股协议的具体内容：

   • 入股协议应当明确双方的权利和义务，包括但不限于入股比例、股权转让方式、利润分配方式、亏损承担方式等。如果入股协议的内容合法、明确且双方均同意，那么这一行为在法律上是可行的。
   • 需要注意的是，入股协议应当符合《公司法》等相关法律法规的规定，例如，股东入股应当履行出资义务，且出资方式应当符合法律规定。如果商户以非货币财产（如设备、技术等）作为出资，应当依法进行评估作价，并办理相应的财产权转移手续。

3. 法律法规的遵守：

   • 商户与房东在协商入股事宜时，应当遵守相关法律法规的规定，不得损害国家、集体或第三人的利益。例如，如果商户或房东存在欺诈、胁迫等行为，或者入股协议的内容违反了法律法规的强制性规定（如禁止性规定），那么这一行为可能是违法的。
   • 此外，如果商户或房东在入股过程中涉及虚假出资、抽逃出资等行为，也可能会面临法律责任。

4. 实际操作中的注意事项：

   • 在实际操作中，商户与房东应当就入股事宜进行充分协商，并签订详细的入股协议。协议中应当明确双方的权利和义务，以及可能出现的风险和责任承担方式。
   • 为了确保入股协议的合法性和有效性，双方可以寻求专业律师的帮助，对协议进行审查和修改。
   • 如果商户与房东在入股过程中发生纠纷，可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决。

法律建议：

• 如果商户与房东就入股事宜达成一致，建议签订详细的入股协议，并明确双方的权利和义务。
• 在签订入股协议前，双方可以寻求专业律师的帮助，对协议进行审查和修改，以确保其合法性和有效性。
• 如果商户或房东在入股过程中遇到法律问题或纠纷，可以及时向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。

可能后果：

• 如果商户与房东的入股协议合法且有效，且双方均按照协议履行义务，那么这一行为将不会产生法律纠纷。
• 如果入股协议存在违法或无效的情形，或者双方未按照协议履行义务，那么可能会引发法律纠纷，甚至可能导致协议被撤销或解除，双方可能需要承担相应的法律责任。