合作开发建设违章建筑，建设成本一般不应全额返还开发方，以下从不同角度进行分析：
法律角度
违章建筑的性质：
- 违章建筑是指未经规划土地主管部门批准，未领取建设工程规划许可证或临时建设工程规划许可证，擅自建筑的建筑物和构筑物。根据《中华人民共和国城乡规划法》等相关法律法规，违章建筑是不受法律保护的，且可能面临拆除、罚款等法律后果。
合作开发合同的效力：
- 如果合作开发合同明确约定了建设违章建筑，那么该合同可能因违反法律、行政法规的强制性规定而被认定为无效合同。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无效的合同自始没有法律约束力，因该合同取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失，双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。
- 在此情况下，由于建设的是违章建筑，开发方可能无法要求全额返还建设成本，因为违章建筑本身就不具有合法性，且可能因拆除等造成损失。法院在判决时，会综合考虑双方的过错程度、实际损失等因素，来确定是否返还以及返还的金额。
返还成本的限制：
- 即使合作开发合同部分有效或未明确约定建设违章建筑，但实际建设了违章建筑，开发方也难以要求全额返还建设成本。因为违章建筑的建设行为本身就违反了法律法规，开发方应当承担相应的法律责任。在返还成本时，法院可能会扣除因违章建筑建设而产生的违法所得、罚款等费用。
实践角度
拆除与补偿：
- 在实践中，违章建筑往往面临被拆除的命运。一旦违章建筑被拆除，开发方不仅无法获得全额的建设成本返还，还可能因拆除而遭受额外的损失。因此，在合作开发建设时，应严格遵守法律法规，避免建设违章建筑。
协商与调解：
- 如果合作开发双方因建设成本返还问题产生纠纷，可以尝试通过协商、调解等方式解决。在协商、调解过程中，双方可以就建设成本的返还金额、方式等达成一致意见，并签订书面协议。这种方式相对灵活、高效，有助于维护双方的合作关系。
诉讼风险：
- 如果协商、调解无果，开发方可能会选择通过诉讼途径解决纠纷。然而，由于违章建筑不受法律保护，开发方在诉讼中可能面临较大的风险。法院在判决时，会综合考虑多种因素，包括双方的过错程度、实际损失、合同约定等，来作出公正的裁决。因此，开发方在提起诉讼前，应充分评估诉讼风险，并做好充分的准备。
建议：在合作开发建设时，应严格遵守法律法规，避免建设违章建筑。如果已经建设了违章建筑，应尽快与相关部门沟通协商，寻求合法的解决方案。同时，在合作开发合同中，应明确约定双方的权利义务、建设成本分担、违约责任等条款，以降低纠纷发生的风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。