结论：在合同纠纷中，如果双方协商好都有责任，认定书是可以认定双方同责的，但具体还需根据实际情况和法律规定来判断。

分析说明：

1. 合同纠纷中的责任认定原则：

   • 在合同纠纷中，责任的认定通常基于合同的约定、双方的行为以及相关法律法规的规定。如果合同中有明确约定双方的责任分配，那么应首先遵循合同约定。
   • 如果合同中没有明确约定，或者约定不明确，那么就需要根据双方的行为以及相关法律法规来推断责任。在这种情况下，如果双方协商一致，认为都有责任，并且这种协商是基于合理的事实和法律依据，那么认定书是可以认定双方同责的。

2. 认定书的作用与效力：

   • 认定书是合同纠纷处理过程中，由相关部门或机构（如法院、仲裁机构等）根据事实和法律作出的责任认定文件。它具有一定的法律效力和约束力，是后续处理纠纷的重要依据。
   • 如果双方协商好都有责任，并且这种协商得到了相关部门或机构的认可，那么认定书就会明确记载双方的责任比例，包括同责的情况。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 虽然双方协商好都有责任，但认定书的出具并不是完全基于双方的协商。相关部门或机构在出具认定书时，还会综合考虑事实、法律以及公平原则等因素。
   • 因此，即使双方协商一致，也不能保证认定书一定会认定双方同责。如果一方对认定结果有异议，还可以通过法律途径进行申诉或诉讼。

法律建议：

• 在合同纠纷中，如果双方协商好都有责任，并希望认定书能认定同责，建议双方在协商过程中尽量明确各自的责任范围和比例，并确保这种协商是基于合理的事实和法律依据。
• 同时，双方也可以寻求专业律师的帮助，以确保协商结果的合法性和有效性。如果认定书出具后，一方对结果有异议，也可以及时咨询律师，了解自己的法律权益和可能的救济途径。

后续行动指南：

• 如果双方已经协商好并希望出具认定书，可以联系相关部门或机构（如法院、仲裁机构等）了解具体的申请流程和所需材料。
• 在申请过程中，确保提供充分、准确的事实和法律依据，以支持双方的协商结果。
• 如果认定书出具后遇到任何问题或争议，及时咨询专业律师以获取法律帮助。