总包代付农民工工资后向分包追偿，立案案由通常可以确定为“追偿权纠纷”。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、追偿权纠纷的法律依据

在总包代付农民工工资的情况下，总包实际上是在履行一种代为清偿的义务。当总包代为支付了本应由分包支付的工资后，总包就取得了向分包追偿的权利。这种权利在法律上通常被认定为追偿权，因此，立案案由可以确定为追偿权纠纷。

二、追偿权纠纷的构成要件

1. 代为清偿行为：总包已经实际代为支付了农民工的工资，这是追偿权产生的前提和基础。
2. 分包的责任：分包原本负有支付农民工工资的义务，但由于某种原因（如资金困难、管理不善等）未能履行。
3. 追偿权的行使：总包在代为支付工资后，有权向分包追偿，要求分包偿还其代为支付的工资及相关费用。

三、立案时的注意事项

1. 证据收集：在立案时，总包需要收集并提交相关证据，以证明其代为支付工资的事实以及分包应承担的责任。这些证据可能包括工资支付记录、分包合同、代为支付协议等。
2. 案由选择：虽然追偿权纠纷是较为常见的案由，但具体案件中也可能涉及其他相关法律关系，如不当得利纠纷、合同纠纷等。因此，在立案时，总包应根据案件具体情况选择合适的案由。不过，在大多数情况下，追偿权纠纷是更为贴切和准确的案由选择。
3. 诉讼请求的明确：在立案时，总包应明确其诉讼请求，即要求分包偿还其代为支付的工资及相关费用，并可能包括利息、违约金等。

四、可能涉及的其他法律观点

虽然追偿权纠纷是主流观点，但在某些特定情况下，也可能存在其他法律观点或案由选择。例如：

1. 不当得利纠纷：如果分包没有合法依据而获得了总包代为支付的工资，那么总包可能以不当得利为由向分包追偿。不过，这种情况相对较少见，因为分包原本就负有支付工资的义务。
2. 合同纠纷：如果总包与分包之间存在关于工资支付的明确合同条款，且分包违反了这些条款，那么总包也可能以合同纠纷为由向分包追偿。但这种情况下，追偿权纠纷与合同纠纷可能存在一定的交叉和重叠。

总结与建议：在总包代付农民工工资后向分包追偿的案件中，立案案由通常可以确定为追偿权纠纷。总包在立案时应收集并提交相关证据，明确诉讼请求，并根据案件具体情况选择合适的案由。如果对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。