针对你提出的问题，关于交通事故工资证明书中是书写停发在此期间工资还是扣出工资的问题，我的建议如下：

结论前置：在交通事故工资证明书中，建议明确书写“停发在此期间工资”，而不是“扣出工资”。

分析说明：

1. 法律角度：

   • 交通事故导致的工资损失，通常属于因事故造成的直接经济损失。在索赔过程中，需要提供明确的工资损失证明。
   • “停发在此期间工资”的表述更直接地反映了因事故导致的工资收入中断，与索赔的实际情况相符。
   • “扣出工资”的表述可能引发误解，因为“扣出”通常用于描述因某种原因（如迟到、早退等）从工资中扣除的款项，与因事故导致的工资损失性质不同。

2. 实际操作角度：

   • 书写“停发在此期间工资”能够更清晰地说明工资损失的起始和结束时间，以及损失的具体金额，有利于索赔的计算和认定。
   • 如果选择“扣出工资”，可能需要额外提供详细的扣款明细和计算方式，增加了索赔的复杂性和不确定性。

3. 建议与注意事项：

   • 在出具工资证明书时，应确保内容的真实性和准确性，避免虚假陈述或误导性信息。
   • 工资证明书应明确注明停发工资的具体时间、金额以及原因（即交通事故），并加盖单位公章或财务专用章以增加其法律效力。
   • 如果因交通事故导致长期或永久性工资损失，应咨询专业律师或相关机构，以便更准确地评估损失并制定相应的索赔策略。

综上所述，从法律角度和实际操作角度来看，建议在交通事故工资证明书中明确书写“停发在此期间工资”，以更直接、清晰地反映因事故导致的工资损失情况。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。