若甲方申请不合理鉴定，可按以下方式处理：

1. 提出书面异议：在收到甲方鉴定申请后，应第一时间仔细审查其申请鉴定的内容、范围及目的。若认为申请不合理，例如鉴定事项与案件争议焦点无关、鉴定方法不科学、鉴定机构或人员不具备相应资质等，应及时向法院或其他相关机构提交书面异议。异议中需详细阐述不合理之处，并提供相应的法律依据和事实依据。例如，若甲方申请对某设备的性能进行鉴定，但该设备性能并非案件争议焦点，且已有充分证据证明其性能状况，此时即可提出异议，指出该鉴定申请与案件无关，不应予以准许。
2. 申请鉴定人出庭或要求重新鉴定：若法院或其他相关机构已准许甲方的鉴定申请，并出具了鉴定意见，但认为该鉴定意见不合理，可在庭审过程中申请鉴定人出庭接受质询。通过向鉴定人提问，揭示其鉴定过程中的瑕疵或不合理之处，从而削弱鉴定意见的证明力。若鉴定意见存在严重错误或瑕疵，还可向法院申请重新鉴定。重新鉴定时，应选择具备相应资质、信誉良好的鉴定机构和鉴定人员，并确保鉴定方法科学、合理。
3. 利用其他证据反驳鉴定意见：在诉讼或仲裁过程中，鉴定意见并非唯一证据。若认为甲方的鉴定申请不合理，且已出具的鉴定意见存在瑕疵，可积极收集其他证据来反驳该鉴定意见。例如，可提供专家意见、相关行业标准、以往类似案例等，以证明鉴定意见的不合理性。这些证据应与案件事实紧密相关，且具备较高的证明力。
4. 关注鉴定费用的承担问题：若甲方的鉴定申请最终被认定为不合理，且因此产生了不必要的鉴定费用，可向法院或其他相关机构提出由甲方承担该费用的请求。根据相关法律规定，因一方当事人的过错导致鉴定费用增加的，增加的费用应由该方当事人承担。因此，在提出该请求时，应提供充分的证据证明甲方的过错行为与鉴定费用增加之间的因果关系。

在处理此类问题时，应保持冷静、理性，并遵循法律程序。若遇到复杂或疑难问题，可直接向我咨询，我将结合具体案情为你提供专业、全面的法律建议。