结论：针对您提出的征地补偿协议只有负责人签字手印，没有公司盖印和法定代表人签字，且现在违约了如何维权的问题，我将从协议效力、维权途径以及具体操作建议三个角度为您详细分析。
一、协议效力分析
协议形式要件：
- 根据一般合同法的原则，合同（包括征地补偿协议）的成立需要双方意思表示一致，并通常要求具备书面形式。书面形式不仅有助于明确双方的权利义务，也是证明合同存在和内容的重要证据。
- 在您的案例中，虽然协议只有负责人签字手印，没有公司盖印和法定代表人签字，但这并不直接导致协议无效。关键在于该负责人是否有权代表公司签订此类协议，以及公司事后是否对协议内容进行了追认。
负责人权限与追认：
- 如果该负责人是公司授权签订征地补偿协议的代理人，或者其行为构成表见代理（即相对人有理由相信其有代理权），则协议对公司具有约束力。
- 如果公司事后对协议内容进行了追认，比如通过实际行动履行了部分或全部协议义务，也视为对公司具有约束力。
协议实际履行情况：
- 协议的实际履行情况也是判断其效力的一个重要因素。如果双方已经按照协议内容部分或全部履行了义务，那么即使协议形式上存在瑕疵，也可能被视为双方对协议内容的认可。
二、维权途径
协商谈判：
- 首先，您可以尝试与对方进行协商谈判，明确双方的权利义务，寻求达成新的和解协议或补充协议，以解决违约问题。
行政投诉：
- 如果协商无果，您可以向当地政府或相关部门（如国土资源部门、拆迁管理部门等）进行投诉，请求他们介入调解或处理违约问题。
法律诉讼：
- 如果行政投诉也无法解决问题，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。具体来说，您可以向法院提起诉讼，要求对方承担违约责任，包括赔偿损失、继续履行协议等。
三、具体操作建议
收集证据：
- 在采取任何维权行动之前，您需要收集尽可能多的证据来证明协议的存在、内容以及对方的违约行为。这些证据可以包括协议文本（即使只有负责人签字手印）、双方沟通记录、履行协议的相关凭证等。
咨询专业律师（此处虽为常规建议，但根据约束条件调整表述）：
- 在处理此类法律问题时，建议您直接向我咨询，我可以根据您的具体情况提供更详细、更专业的法律建议和操作方案。
注意诉讼时效：
- 如果您决定通过法律途径维权，请注意诉讼时效的问题。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，一般诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。因此，您需要在诉讼时效期间内提起诉讼。
总结：针对您的情况，我建议您首先尝试与对方协商谈判，同时收集相关证据以备不时之需。如果协商无果，您可以考虑向当地政府或相关部门进行投诉，或者直接向我咨询并考虑通过法律途径来维护自己的权益。在处理此类问题时，请务必注意诉讼时效的问题，以免错过最佳的维权时机。