结论：征地补偿协议应签字4份，但实际只有三个人签字盖章，另一份只盖了个红印还不清楚，这种情况可能涉及协议签署的规范性问题，甚至可能影响到协议的效力。以下从多个角度进行分析：
一、协议签署的规范性要求
签字盖章的完整性：
- 征地补偿协议作为双方权利义务的重要约定，应当确保每一份协议都经过双方当事人的签字或盖章确认，以体现协议的真实性和合法性。
- 在本案例中，如果协议应签字4份，但实际只有三个人签字盖章，另一份只盖了个红印还不清楚，这显然不符合协议签署的完整性要求。
红印的效力问题：
- 红印（如公章、合同章等）在法律上通常具有一定的效力，但前提是红印必须清晰可辨，且加盖在协议的适当位置。
- 如果红印不清晰，或者加盖的位置不符合协议签署的常规要求（如未加盖在签字处或协议末尾），则可能影响红印的效力，进而影响协议的效力。
二、可能产生的法律后果
协议效力争议：
- 由于协议签署不规范，可能导致协议效力产生争议。如果一方当事人主张协议无效或可撤销，而另一方当事人则主张协议有效，则可能引发法律纠纷。
- 在这种情况下，法院或仲裁机构将根据相关法律法规和协议的具体内容，对协议的效力进行认定。
权利义务履行障碍：
- 如果协议效力被认定存在问题，那么双方当事人基于协议所享有的权利和承担的义务也可能受到影响。
- 这可能导致一方或双方当事人在履行协议过程中遇到障碍，甚至可能引发进一步的法律纠纷。
三、建议措施
重新签署协议：
- 鉴于协议签署不规范可能带来的法律风险，建议双方当事人重新签署征地补偿协议，确保每一份协议都经过双方当事人的签字或盖章确认，且红印清晰可辨。
保留证据：
- 在重新签署协议之前，双方当事人应妥善保管好已有的协议文本和相关证据材料，以备不时之需。
- 如果可能的话，还可以对协议签署过程进行录音录像等取证工作，以进一步证明协议的真实性和合法性。
咨询专业律师：
- 如果双方当事人对协议签署的规范性要求或可能产生的法律后果存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师进行解答和指导。
- 作为专业律师，我可以根据具体情况提供详细的法律意见和解决方案，帮助双方当事人妥善处理相关问题。
四、特殊情况考虑
- 如果另一份只盖红印的协议是由于特殊原因（如紧急情况、一方当事人无法到场等）而未能及时签字盖章，且双方当事人对此均无异议，那么可以考虑通过补充协议或书面确认的方式对原协议进行补正和确认。但这种情况需要谨慎处理，并确保符合相关法律法规的规定。
总之，征地补偿协议的签署应当严格遵守相关法律法规和规范性要求，以确保协议的真实性和合法性。如果遇到签署不规范或存在争议的情况，建议及时咨询专业律师并采取相应措施进行处理。