核心结论：面包车拉小学生超员1人，运管不扣车的情况下，可能会采取警告、罚款、记分、责令整改、移交其他部门处理等措施，具体如下：

1. 警告
   • 对于情节轻微、未造成严重后果的超员行为，运管部门可能会首先给予口头或书面警告。这是基于《中华人民共和国道路交通安全法》等相关法律法规，对违法行为人的一种教育和警示方式，目的是让驾驶人认识到超员行为的危险性和违法性，促使其自觉遵守交通法规。例如，如果驾驶人是因为临时接送孩子，且超员人数较少，同时态度诚恳，认识到错误，运管部门可能会选择警告处理。
2. 罚款
   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条规定，公路客运车辆载客超过额定乘员的，处二百元以上五百元以下罚款；超过额定乘员百分之二十或者违反规定载货的，处五百元以上二千元以下罚款。虽然面包车不一定属于公路客运车辆，但如果其用于接送学生，且存在超员行为，运管部门可以参照类似规定，根据超员的严重程度，对驾驶人处以相应金额的罚款。比如超员1人，可能会被处以二百元以上五百元以下的罚款。
3. 记分
   • 依据《机动车驾驶证申领和使用规定》，驾驶营运客车（不包括公共汽车）、校车载人超过核定人数未达20%的，或者驾驶其他载客汽车载人超过核定人数20%以上的，一次记6分；驾驶营运客车（不包括公共汽车）、校车以外的载客汽车载人超过核定人数未达20%的，一次记3分。面包车拉小学生超员1人，若未达到核定人数20%，一般一次记3分；若达到或超过20%，则一次记6分。记分制度是对驾驶人违法行为的一种累积记录方式，当记分达到一定分值时，驾驶人需要参加交通安全法律法规学习并接受考试，甚至可能面临吊销驾驶证等更严重的处罚。
4. 责令整改
   • 运管部门会责令驾驶人立即消除超员状态，安排其他合法合规的交通工具将超员的学生转运，确保学生的安全。同时，要求驾驶人承诺今后不再出现类似的超员行为，并签订相关的承诺书。如果驾驶人所属的单位（如学校、运输公司等）存在管理不善等问题，运管部门还会责令该单位加强管理，完善相关制度，防止类似事件再次发生。
5. 移交其他部门处理
   • 如果超员行为涉及到其他违法违规问题，如非法营运、使用未经检验合格的车辆等，运管部门可能会将案件移交给其他相关部门，如交通运输综合行政执法部门、市场监管部门等，由这些部门根据各自的职责和法律法规进行进一步的处理。例如，如果面包车没有取得相应的营运资质而从事接送学生的业务，就属于非法营运，应由交通运输综合行政执法部门进行查处。

特殊情况说明：如果运管部门不扣车，并不意味着驾驶人的违法行为不严重或者不需要承担法律责任。扣车只是一种行政强制措施，运管部门会根据具体的违法情节、危害后果等因素来决定是否采取扣车措施。即使不扣车，驾驶人仍然需要接受上述其他形式的处罚。

建议：作为驾驶人，一定要严格遵守交通法规，杜绝超员行为，确保学生的出行安全。如果遇到运管部门的检查，要积极配合，如实说明情况，接受相应的处理。如果有任何疑问或异议，可以在规定的时间内依法申请行政复议或提起行政诉讼。