结论：临聘教师能否申请签订三年合同，需结合具体法律规定、事业单位用工政策及双方协商情况综合判断，仅持有保育员证且工作十二年并不直接赋予签订三年合同的法定权利，但可作为协商的参考因素。

1. 从法律规定角度分析：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同的期限由用人单位与劳动者协商一致确定，可以签订固定期限劳动合同、无固定期限劳动合同或以完成一定工作任务为期限的劳动合同。法律并未明确规定临聘教师必须签订何种期限的合同，也未规定仅持有保育员证且工作一定年限就必须签订三年合同。
   • 若临聘教师符合签订无固定期限劳动合同的条件（如在该用人单位连续工作满十年且距法定退休年龄不足十年等），则有权要求签订无固定期限劳动合同，但这与签订三年合同是不同的概念。

2. 从事业单位用工政策角度分析：

   • 事业单位的用工政策可能因地区、单位性质、岗位需求等因素而有所不同。有些事业单位可能对于临聘人员的合同期限有内部规定或惯例，这些规定或惯例可能受到上级主管部门或相关政策的指导。
   • 因此，临聘教师能否签订三年合同，还需参考所在事业单位的具体用工政策。

3. 从双方协商角度分析：

   • 劳动合同的签订是双方协商一致的结果。临聘教师有权提出签订三年合同的申请，但用人单位有权根据岗位需求、人员配置、预算安排等因素决定是否同意。
   • 若双方能够就合同期限达成一致意见，则可以签订三年合同；若无法达成一致，则可能签订其他期限的合同或无法续签。

4. 持有保育员证及工作年限的影响：

   • 持有保育员证且工作十二年，说明临聘教师具备一定的专业能力和工作经验，这可能成为其与用人单位协商签订较长期限合同的有利因素。
   • 但这一因素并不直接决定合同期限，而是作为双方协商时的参考依据之一。

建议：

• 临聘教师若希望签订三年合同，可首先了解所在事业单位的用工政策及内部规定；
• 然后与用人单位进行友好协商，明确表达自己的诉求和理由；
• 若协商无果，可咨询当地劳动行政部门或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。

如有其他法律疑问，欢迎直接向我咨询。