存在非法占用农地罪案例中不予起诉的情况。以下从不同角度为你详细分析：

法定不起诉情形

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条规定，有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：

1. 情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的：如果非法占用农地的行为，虽然形式上符合非法占用农地罪的构成要件，但情节显著轻微，例如占用农地面积极小，对农地的破坏程度极低，没有造成实质性的损害后果，且行为人主观恶性较小，那么可能被认定为不构成犯罪，从而不予起诉。比如，某村民为了临时堆放少量自家农具，在自家承包的极小面积农地上搭建了一个简易棚子，占用时间短暂，未对农地造成明显破坏，这种情况就可能因情节显著轻微而不予起诉。
2. 犯罪已过追诉时效期限的：非法占用农地罪的追诉时效期限根据法定最高刑来确定。如果犯罪行为已经超过了法定的追诉时效期限，那么就不再追究刑事责任，不予起诉。例如，非法占用农地行为发生在多年前，按照法律规定已经超过了追诉时效，那么即使后来被发现，也可能不予起诉。
3. 经特赦令免除刑罚的：如果行为人符合国家特赦的条件，经特赦令免除刑罚的，那么对于该非法占用农地的行为就不再起诉。不过这种情况相对较为少见，需要特定的国家政策和特赦令的出台。
4. 依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的：非法占用农地罪不属于告诉才处理的犯罪，所以此条在本罪中不适用。
5. 犯罪嫌疑人、被告人死亡的：如果犯罪嫌疑人在案件侦查、审查起诉阶段死亡，那么就不再对其追究刑事责任，不予起诉。例如，非法占用农地的犯罪嫌疑人在公安机关立案侦查后，因意外事故死亡，此时就会不予起诉。

酌定不起诉情形

酌定不起诉，又称相对不起诉或犯罪情节轻微不起诉，是指人民检察院对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的，可以作出不起诉决定。在非法占用农地罪中，以下情况可能适用酌定不起诉：

1. 犯罪情节轻微：虽然行为人的行为构成了非法占用农地罪，但犯罪情节较轻。例如，非法占用的农地面积不大，且在占用后积极采取措施恢复农地原状，对农地的损害较小；或者行为人主观上是为了解决一些紧急的生活或生产困难，并非出于恶意非法占用农地等。在这种情况下，人民检察院可以根据案件的具体情况，认为不需要判处刑罚或免除刑罚的，作出不起诉决定。
2. 具有自首、立功等法定从轻、减轻情节：如果行为人在非法占用农地后，主动向公安机关投案自首，如实供述自己的罪行，或者有立功表现，如揭发他人犯罪行为、提供重要线索协助侦破其他案件等，那么根据刑法的规定，可以从轻或者减轻处罚。在这种情况下，如果犯罪情节本身也比较轻微，人民检察院可能会考虑作出不起诉决定。
3. 认罪认罚：行为人在审查起诉阶段认罪认罚，签署认罪认罚具结书，且犯罪情节轻微，人民检察院可以依法作出不起诉决定。认罪认罚从宽制度是我国刑事诉讼中的一项重要制度，旨在鼓励犯罪嫌疑人、被告人自愿认罪认罚，提高诉讼效率，节约司法资源。在非法占用农地罪中，如果行为人认罪认罚，且符合不起诉的条件，人民检察院可以酌情作出不起诉决定。

证据不足不起诉情形

证据不足不起诉，又称存疑不起诉，是指人民检察院对于经过补充侦查的案件，仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉决定。在非法占用农地罪中，如果公安机关侦查终结后移送人民检察院审查起诉的案件，证据存在以下问题，人民检察院可能会作出证据不足不起诉的决定：

1. 证据不充分：例如，无法证明行为人实施了非法占用农地的行为，或者无法证明占用的农地面积达到了犯罪的标准，或者无法证明行为人主观上具有非法占用的故意等。如果证据不足以支持起诉，人民检察院就会作出不起诉决定。
2. 证据存在矛盾：案件中的证据之间存在矛盾，无法形成完整的证据链条，不能排除合理怀疑。例如，证人证言之间相互矛盾，或者物证、书证与证人证言、犯罪嫌疑人供述等证据之间存在不一致的情况，且无法合理解释和排除这些矛盾，那么人民检察院可能会认为证据不足，作出不起诉决定。

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