面对科主任扣医生绩效的情况，医生可以通过一系列合法且有条理的途径来维护自己的权益。以下是一些详细的建议：
一、内部沟通与协商
与科主任直接沟通：
- 首先，建议医生与科主任进行友好、理性的沟通，了解扣绩效的具体原因。在沟通时，选择一个合适的时间和地点，以平和的态度表达自己的关切和疑问。
- 医生可以准备好自己的工作成果报告、患者评价等材料，以展示自己的工作表现和绩效达标情况，要求科主任明确说明扣绩效的依据和计算方式。
向医院人力资源部门反映：
- 如果与科主任的沟通没有达成满意的结果，医生可以向医院的人力资源部门提交书面申诉材料。在材料中，详细说明自己的岗位情况、绩效任务完成情况、应得绩效工资数额以及被扣的具体金额。
- 同时，附上相关的证明材料，如绩效评估表、工作指标完成记录等，以便人力资源部门进行调查和核实。
寻求医院工会帮助：
- 医生还可以考虑向医院的工会寻求帮助。工会通常会为会员提供法律咨询和援助，协助医生与医院管理层进行沟通，争取合法权益。
二、向外部机构投诉
向劳动监察部门投诉：
- 如果内部沟通未能解决问题，医生可以向当地的劳动监察部门投诉。在投诉时，准备好劳动合同、工资条、绩效评估文件以及与医院沟通的记录等证据材料。
- 劳动监察部门有权对医院的工资支付情况进行检查，并责令其改正违法行为。投诉后，医生将收到调查处理结果的反馈。
向卫生健康行政部门反映：
- 由于医院属于卫生健康行业，医生也可以向当地的卫生健康行政部门反映扣绩效的问题。该部门对医院有监督职责，可能会介入调查并促使医院解决问题。
三、法律手段维权
申请劳动争议仲裁：
- 如果上述途径均未能解决问题，医生可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在提交仲裁申请书时，明确请求事项，如要求医院足额支付扣的绩效工资、支付赔偿金等，并详细陈述事实和理由。
- 附上充分的证据材料，仲裁委员会将安排开庭审理，双方进行举证、质证和辩论。仲裁裁决具有法律效力，医院需按裁决结果执行。
咨询律师或提起诉讼：
- 在整个维权过程中，医生可以考虑咨询专业律师，获取更具体的法律建议和指导。如果仲裁结果仍不满意，医生有权向人民法院提起诉讼，通过司法程序维护自身权益。
四、注意事项
- 保存证据：在整个维权过程中，医生应特别注意收集和保存各类证据，如工作记录、绩效评估表、沟通记录等。这些证据是维护自身权益的关键。
- 保持冷静：面对问题，医生应保持冷静和理智，避免采取过激行为。通过合法途径理性维权，更有可能实现问题的妥善解决。
综上所述，面对科主任扣医生绩效的情况，医生应通过多种途径积极维护自身合法权益。通过内部沟通、外部投诉以及法律手段等综合运用，相信医生一定能够成功维护自己的权益。