在交通事故涉及刑事案件的情况下，责任认定书通常由公安机关交通管理部门出具。以下是对此问题的详细解释：

一、责任认定书的出具主体

根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，公安机关交通管理部门是负责处理交通事故、进行事故责任认定的法定机构。在交通事故发生后，公安机关交通管理部门会派员前往现场进行勘查、调查取证，并根据调查结果出具交通事故责任认定书。这份认定书是处理交通事故、确定各方责任的重要依据。

二、刑事案件中的特殊情况

当交通事故涉及刑事案件时，如交通肇事罪等，公安机关交通管理部门在出具责任认定书的同时，还会将案件移送至公安机关的刑事侦查部门进行进一步调查。刑事侦查部门会根据事故的具体情况、证据材料等，对涉嫌犯罪的行为人进行立案侦查，并可能依法采取刑事强制措施。然而，这并不影响公安机关交通管理部门出具责任认定书的职责和程序。责任认定书仍然是由公安机关交通管理部门根据事故现场勘查、调查取证等结果出具的。

三、责任认定书的内容与作用

交通事故责任认定书通常包含事故发生的时间、地点、当事人信息、事故经过、事故原因、责任划分等内容。它是处理交通事故、确定赔偿、追究刑事责任等的重要依据。在涉及刑事案件的交通事故中，责任认定书不仅为刑事侦查部门提供了重要的证据材料，也为后续的刑事诉讼程序奠定了基础。

四、对责任认定书的异议与复核

如果当事人对交通事故责任认定书有异议，可以在规定的时间内向上一级公安机关交通管理部门提出书面复核申请。复核申请应当载明复核请求及其理由和主要证据。上一级公安机关交通管理部门会在收到复核申请后，按照规定程序进行复核，并作出复核结论。

总结来说，在交通事故涉及刑事案件的情况下，责任认定书仍然是由公安机关交通管理部门出具的。这份认定书对于处理交通事故、确定各方责任以及后续的刑事诉讼程序都具有重要意义。如果您在交通事故中遇到涉及刑事案件的情况，或者对责任认定书有异议，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。