当公司进入清算程序时，员工的权益保障是至关重要的环节。根据《中华人民共和国劳动法》《中华人民共和国劳动合同法》及相关法规，公司清算时需对员工进行一系列合理的赔偿。以下是对公司清算时员工赔偿问题的详细解答：
一、经济补偿金
法律依据：
- 根据《劳动合同法》第四十四条，用人单位被依法宣告破产或决定提前解散的，劳动合同终止。
- 第四十六条规定，用人单位需按第四十四条规定终止劳动合同的，应向劳动者支付经济补偿。
- 第四十七条明确了经济补偿的计算方式：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的按一年算；不满六个月的支付半个月工资。
月工资定义：
- 月工资指劳动合同解除前十二个月的平均工资，包括计时/计件工资、奖金、津贴等货币性收入，但不得高于当地职工月平均工资的三倍。
示例：
- 如员工在公司工作3年8个月，月工资为5000元，则经济补偿金为4×5000=20,000元。
二、工资、加班费及奖金
- 工资：公司应支付员工至劳动合同解除之日止的工资，按照劳动合同约定的标准和出勤情况进行结算。
- 加班费：公司需支付员工加班期间的相应加班费，包括延长工作时间、休息日及法定休假日的加班费用。
- 奖金：若员工根据公司规章制度或劳动合同约定有资格获得奖金（如年终奖、绩效奖等），公司应按规定支付，即使在公司清算当年也应按比例发放。
三、社会保险及住房公积金
公司应为员工足额缴纳清算前的社会保险费（包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险）和住房公积金。若存在未足额缴纳情况，员工有权要求公司补缴，以确保其社保权益不受损害。
四、特殊情形处理
拖欠工资与社保：
- 清算组需优先清偿员工工资、医疗/伤残补助、抚恤费用及欠缴的社保费用。
未提前通知解除合同：
- 若公司未提前30日书面通知解除劳动合同，需额外支付一个月工资的代通知金。代通知金的标准按照该劳动者上一个月的工资确定。
违法解除合同的赔偿金：
- 若公司违反法律规定解除合同，员工可主张双倍经济补偿标准的赔偿金（即“2N”原则）。
五、清算流程中的员工权益保障步骤
成立清算组：
- 公司应在解散事由出现后15日内成立清算组，成员包括股东、董事或专业机构人员。
制定清偿方案：
- 清算组需在清理资产、编制资产负债表后，制定包含员工薪酬在内的清偿方案，并报股东大会或法院确认。
公告与申报债权：
- 清算组需在报纸上公告，通知债权人（含员工）申报债权，员工需在规定期限内提交工资证明等材料。
分配剩余财产：
- 清偿顺序为：破产费用和共益债务→员工工资及社保费用→税款→普通债权。
六、员工维权途径
协商与调解：
劳动仲裁：
- 向劳动合同履行地或公司所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，时效为一年。
法律诉讼：
七、注意事项
- 保留证据：保存劳动合同、工资条、考勤记录等材料。
- 及时申报：关注清算公告，按时申报债权。
- 法律咨询：复杂情况下建议寻求律师帮助。
综上所述，公司清算时员工的赔偿范围涵盖经济补偿金、工资、加班费、奖金、社会保险及住房公积金、代通知金（特定情况下）以及其他福利待遇。为确保员工的合法权益得到妥善保障，建议在进行公司清算时咨询专业律师或相关机构。