结论：公司对误发违禁品的快递员处以1000元罚款是否合理，需结合公司规章制度、劳动合同约定以及相关法律法规综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、公司规章制度与劳动合同的约定
公司规章制度：
- 如果公司有明确的规章制度，且该制度中规定了误发违禁品的处罚措施，包括罚款金额，那么公司依据该制度进行处罚是合理的。但前提是该制度必须合法合规，且已向员工公示或告知。
- 法律依据：根据《劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
劳动合同约定：
- 如果劳动合同中明确约定了误发违禁品的处罚措施，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司依据劳动合同进行处罚也是合理的。
- 注意点：劳动合同中的约定不得违反法律法规的强制性规定，否则该约定无效。
二、相关法律法规的考量
罚款的合法性：
- 根据现行法律法规，用人单位并非对任何违纪行为都有罚款权。罚款通常属于行政处罚范畴，而用人单位并非行政机关，因此其罚款权受到严格限制。
- 例外情况：如果公司规章制度或劳动合同中明确约定了罚款，且该约定不违反法律法规的强制性规定，同时罚款金额合理，那么公司可以依据约定进行罚款。但罚款金额一般不应过高，且应与违纪行为的性质、情节以及造成的后果相适应。
违禁品处理的法律规定：
- 快递员误发违禁品可能涉及违反邮政管理、安全生产等相关法律法规。如果因此给公司造成损失，公司有权要求快递员承担赔偿责任。但赔偿金额应与实际损失相符，且不得超过快递员在签订劳动合同时可预见的范围。
- 法律依据：根据《民法典》第一千一百六十五条，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。依照法律规定推定行为人有过错，其不能证明自己没有过错的，应当承担侵权责任。
三、具体建议
核查公司规章制度与劳动合同：
- 建议你首先核查公司的规章制度和劳动合同中是否有关于误发违禁品的处罚措施约定。如果有，且该约定合法合规，那么公司处罚1000元可能是合理的。
评估罚款金额的合理性：
- 如果公司规章制度或劳动合同中有罚款约定，但你认为罚款金额过高或不合理，可以与公司进行协商，寻求降低罚款金额或采取其他处罚措施。
考虑法律途径：
- 如果你认为公司的处罚措施违反了法律法规或劳动合同约定，且协商无果，你可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益。例如，向劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
总结：公司对误发违禁品的快递员处以1000元罚款是否合理，需结合公司规章制度、劳动合同约定以及相关法律法规综合判断。如果你对此有疑问或认为公司的处罚措施不合理，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。