公司纪检组单独和员工谈话超过12小时，这一行为在法律上并不被直接认定为合法或非法，但可能涉及侵犯员工合法权益的问题，具体需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 从劳动法角度：

   • 劳动法主要关注的是劳动者与用人单位之间的劳动关系，以及劳动者在劳动过程中的权益保护。虽然劳动法没有直接规定纪检组谈话的时间限制，但长时间谈话可能间接影响劳动者的休息权、健康权等。
   • 如果谈话发生在工作时间之外，且未给予员工合理的休息时间，可能构成对员工休息权的侵犯。员工有权要求合理的休息时间，并有权拒绝在非工作时间进行长时间的谈话。

2. 从人身自由权角度：

   • 根据《中华人民共和国宪法》第三十七条，中华人民共和国公民的人身自由不受侵犯。任何公民，非经人民检察院批准或者决定或者人民法院决定，并由公安机关执行，不受逮捕。禁止非法拘禁和以其他方法非法剥夺或者限制公民的人身自由。
   • 虽然纪检组谈话并非逮捕或拘禁，但长时间限制员工离开特定场所，可能构成对员工人身自由权的限制。如果谈话过程中存在强制、威胁等手段，更可能涉嫌违法。

3. 从谈话程序与目的角度：

   • 纪检组谈话通常是为了调查违纪行为或了解相关情况。然而，谈话应当遵循合法、公正、合理的原则，不得侵犯员工的合法权益。
   • 如果谈话目的正当，但方式不当（如长时间谈话、侵犯隐私等），员工有权提出异议，并要求谈话在合理的时间内进行。

4. 建议与应对措施：

   • 员工角度：如果员工认为纪检组谈话时间过长或方式不当，可以要求谈话在合理的时间内进行，并有权拒绝不合理的要求。同时，员工可以记录谈话时间、地点、内容等信息，以备后续维权之需。
   • 公司角度：公司纪检组在谈话时应当尊重员工的合法权益，遵循合法、公正、合理的原则。谈话前应明确谈话目的、时间、地点等事项，并告知员工相关权利。谈话过程中应确保员工的人身自由不受侵犯，避免使用强制、威胁等手段。

可能涉及的法律后果：

• 如果纪检组谈话行为被认定为侵犯员工合法权益，员工有权向相关部门投诉或寻求法律援助。公司可能面临法律责任，包括赔偿员工损失、承担行政责任等。

总结：公司纪检组单独和员工谈话超过12小时，虽然不直接构成违法，但可能涉及侵犯员工合法权益的问题。员工有权要求谈话在合理的时间内进行，并有权拒绝不合理的要求。公司应当尊重员工的合法权益，遵循合法、公正、合理的原则进行谈话。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。