结论：兄妹间有关于父母房产的协议，去法院起诉时是否按继承纠纷处理，需根据协议的具体内容来确定。若协议涉及继承权的放弃或分配，则可能按继承纠纷处理；若协议主要处理的是房产的买卖、赠与等非继承事宜，则可能按其他案由处理。

分析说明：

1. 协议内容涉及继承权：

   • 如果兄妹间的协议明确涉及到了父母房产的继承权问题，比如某一方放弃继承权，或者对继承份额进行了分配，那么这份协议在本质上就是一份关于继承权的约定。在这种情况下，如果因协议履行等问题产生纠纷，去法院起诉时，案由很可能会被确定为继承纠纷。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》中关于继承的规定，继承开始后，继承人可以放弃继承，也可以协商确定继承份额。因此，涉及继承权放弃或分配的协议，属于继承纠纷的范畴。

2. 协议内容不涉及继承权，而是处理其他事宜：

   • 如果兄妹间的协议主要是关于父母房产的买卖、赠与、管理或其他非继承事宜，那么这份协议在本质上就不是一份关于继承权的约定。在这种情况下，如果因协议履行等问题产生纠纷，去法院起诉时，案由将根据协议的具体内容来确定，可能是房屋买卖合同纠纷、赠与合同纠纷或其他相关案由，而不是继承纠纷。
   • 举例说明：比如，兄妹间签订了一份协议，约定将父母的房产出售，并将售房款按一定比例分配。这份协议主要处理的是房产的出售和款项分配问题，与继承权无直接关联。因此，因这份协议产生的纠纷，案由将不是继承纠纷。

行动建议：

• 在决定去法院起诉前，建议先仔细审查兄妹间的协议内容，明确协议的具体条款和目的。
• 如果协议涉及继承权问题，且因协议履行产生纠纷，可以考虑按继承纠纷的案由去法院起诉。
• 如果协议主要处理的是房产的其他事宜，如买卖、赠与等，且因协议履行产生纠纷，则需要根据协议的具体内容来确定案由，并准备相应的证据材料。
• 在起诉前，建议咨询专业律师（即我本人，滑风龙律师，专注于婚姻家庭、刑事辩护领域），以获取更具体的法律建议和指导。