员工违反公司安全规定时，企业对其进行罚款是不合法的。以下是对这一问题的详细解答：
一、法律依据与罚款权力的归属
法律依据：
- 自2008年1月15日《企业职工奖惩条例》被废止后，我国法律并未明确赋予企业对员工进行罚款的权力。罚款作为经济处罚措施，涉及公民财产权的剥夺，必须严格由法律、法规和规章设定。
- 企业并非行政机关，不具备法律授予的罚款权力。因此，企业对员工违反安全规定的行为进行罚款，在法律上是不被认可的。
罚款权力的归属：
- 罚款是行政处罚的一种形式，必须由具有处罚权的行政机关或法律、法规授权的组织实施。企业作为非行政机关，不具备这一权力。
二、企业可采取的合法措施
尽管企业不能对员工进行罚款，但可以依据合法有效的规章制度采取其他相应措施来处理员工的违规行为：
规章制度约束：
- 企业应通过民主程序制定完善的规章制度，明确员工在安全方面的职责和义务，以及违反规定的相应处理措施。这些措施可以包括批评教育、警告、记过、降职、解除劳动合同等。
- 规章制度必须确保内容合理合法，不违反法律的强制性规定，并向员工进行公示或告知，以确保员工知晓并遵守。
经济赔偿：
- 若员工违反安全规定的行为给企业造成了实际经济损失，企业可以要求员工进行赔偿。
- 赔偿金额可以从员工工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
三、遵循法律法规的重要性与建议
遵循法律法规的重要性：
- 企业在处理员工违反安全规定的问题时，必须严格遵循法律法规的规定，以确保自身行为的合法性。
- 任何管理措施都应确保合法合规，以避免可能的劳动纠纷和法律风险。
建议与指导：
- 建议企业在制定和执行安全规章制度时，充分考虑员工的权益和企业的合法权益，确保规章制度的合理性和合法性。
- 如在处理员工违规行为过程中遇到疑问或争议，企业应及时咨询专业律师或相关机构，以获取准确的法律意见和帮助，确保处理方式的合法性和有效性。
综上所述，员工违反公司安全规定时，企业不能对其进行罚款，但可以依据合法有效的规章制度采取其他相应措施，并确保所有管理措施都符合法律法规的规定。