结论前置：入职时签电子合同，离职时签书面离职，对劳动者一般没有负面影响，但具体影响需结合合同内容、离职流程及法律规定综合判断。以下从不同角度详细分析：
一、合同形式对劳动者权益的影响
电子合同的有效性：
- 根据《中华人民共和国民法典》第四百六十九条，当事人订立合同，可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。以电子数据交换、电子邮件等方式能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文，视为书面形式。因此，电子合同与书面合同具有同等法律效力，只要电子合同内容合法、双方真实意思表示，即对双方具有约束力。
离职时签书面离职的影响：
- 离职时签订书面离职文件，通常是为了明确离职时间、离职原因、工作交接、薪资结算等事项，这有助于保护劳动者的权益，避免后续纠纷。书面离职文件可以作为劳动者已履行离职手续的证据，对于劳动者来说是有利的。
二、合同内容与离职流程的合规性
合同内容合法性：
- 无论是电子合同还是书面合同，其内容必须符合法律法规的规定，不得侵犯劳动者的合法权益。例如，合同中不得约定违反法律规定的试用期、违约金等条款。如果合同内容存在违法情形，劳动者有权拒绝履行，并可向劳动监察部门投诉。
离职流程的合规性：
- 离职流程应遵循法律法规的规定，如提前通知期限、工作交接、薪资结算等。劳动者在离职时，应确保已按照公司规定和法律法规的要求完成离职手续，包括签订书面离职文件（如果公司要求）。这有助于避免后续因离职流程不合规而产生的纠纷。
三、可能存在的风险与应对建议
风险点：
- 如果电子合同中存在对劳动者不利的条款（如不合理的违约金、竞业限制等），而劳动者在签订时未仔细阅读或未充分理解，可能在离职时面临经济损失。
- 如果离职时未签订书面离职文件，而公司又否认劳动者已离职或拒绝支付薪资等，劳动者可能面临举证困难的问题。
应对建议：
- 在签订电子合同时，劳动者应仔细阅读合同条款，特别是关于薪资、工作时间、离职条件、违约金等关键条款，确保自己的权益不受侵害。如有疑问，应及时向公司或法律专业人士咨询。
- 在离职时，劳动者应按照公司要求签订书面离职文件，并保留好相关证据（如离职文件复印件、邮件通知等），以备不时之需。
- 如遇公司违法或侵权行为，劳动者应及时向劳动监察部门投诉或寻求法律援助，维护自己的合法权益。
总结来说，入职时签电子合同、离职时签书面离职，对劳动者一般没有负面影响，但关键在于合同内容的合法性和离职流程的合规性。劳动者在签订合同和离职时，应仔细阅读合同条款、遵守离职流程，并保留好相关证据，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。