行政机关以国家秘密为由不予信息公开，并不一定违法，但需严格遵循法定条件和程序。以下从多个角度对此问题进行分析：

一、法律依据与原则

根据《中华人民共和国政府信息公开条例》的相关规定，行政机关在公开政府信息时，应当遵循公正、公平、合法、便民的原则，确保信息的及时、准确公开。然而，该条例同时也规定，行政机关不得公开涉及国家秘密、商业秘密、个人隐私的政府信息，除非经权利人同意公开或者行政机关认为不公开可能对公共利益造成重大影响的涉及商业秘密、个人隐私的政府信息。

二、国家秘密的认定与程序

1. 国家秘密的认定：国家秘密是指关系国家的安全和利益，依照法定程序确定，在一定时间内只限一定范围的人员知悉的事项。行政机关在认定某项信息是否属于国家秘密时，必须依据相关法律法规和保密规定，进行严格的审查和判断。

2. 不予公开的程序：如果行政机关认为某项政府信息涉及国家秘密，决定不予公开，那么它必须遵循法定的程序。这通常包括内部审批、保密审查等环节，以确保决定的合法性和合理性。同时，行政机关还应当对不予公开的信息进行登记和归档，以备后续查阅和监督。

三、违法性的判断标准

1. 未经法定程序认定：如果行政机关未经法定程序，擅自将某项信息认定为国家秘密并拒绝公开，那么这种行为可能构成违法。因为行政机关在行使权力时，必须遵循法定程序，确保决定的合法性和公正性。

2. 滥用国家秘密名义：如果行政机关滥用国家秘密的名义，将本应公开的信息拒绝公开，以逃避监督或掩盖违法行为，那么这种行为同样构成违法。这不仅损害了公民的知情权，也破坏了政府信息公开制度的权威性和严肃性。

四、法律后果与救济途径

1. 法律后果：如果行政机关以国家秘密为由不予信息公开的行为被认定为违法，那么它可能面临行政复议、行政诉讼等法律后果。在行政复议或行政诉讼中，行政机关需要证明其不予公开的决定是合法、合理的，否则将承担败诉的风险。

2. 救济途径：对于行政机关以国家秘密为由不予信息公开的行为，公民、法人或其他组织可以通过多种途径来维护自身权益。他们可以向上一级行政机关或政府信息公开工作主管部门进行投诉、举报，要求这些机关对违规行为进行调查和处理。同时，他们还可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，通过法律手段追究责任并获得赔偿。

五、建议与注意事项

1. 加强内部管理：行政机关应当加强内部管理，完善信息公开机制，确保政府信息的真实性和准确性。同时，行政机关还应当加强对国家秘密的保护和管理，防止信息泄露和滥用。

2. 增强透明度与公信力：行政机关应当积极履行信息公开义务，增强政府工作的透明度和公信力。这有助于提升公众对政府的信任和支持，促进社会的和谐稳定。

3. 谨慎认定国家秘密：行政机关在认定某项信息是否属于国家秘密时，应当谨慎行事，确保认定的准确性和合法性。避免滥用国家秘密的名义来拒绝公开信息或掩盖违法行为。

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