公司法人拿走股东的入股协议书不归还，这一行为本身并不直接构成违法犯罪，但可能涉及民事纠纷或违反公司治理规范，具体需根据行为动机、后果及协议内容来判断。以下从不同角度进行分析：
一、民事纠纷角度
协议性质与归属：入股协议书是股东与公司之间，或股东之间就入股事宜达成的书面协议，其本质属于民事合同。协议书的原件或复印件通常应由协议各方共同保管或按约定方式保管。若公司法人未经股东同意，擅自拿走并拒绝归还，可能侵犯了股东对协议书的合法保管权或使用权。
侵权责任：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。若公司法人的行为导致股东无法正常使用协议书，如因协议书丢失而无法证明其股东身份或权益，股东有权要求公司法人承担相应的民事责任，包括但不限于赔偿损失、恢复原状等。
二、公司治理与内部管理角度
公司章程与内部规定：公司章程或内部管理制度可能对协议书的保管、使用等作出具体规定。若公司法人违反这些规定，拿走并拒绝归还协议书，可能构成对公司治理规范的违反。此时，公司或其他股东有权根据公司章程或内部规定，对公司法人进行相应的纪律处分或采取其他管理措施。
股东权益保护：股东作为公司的投资者，其权益应受到保护。若公司法人的行为损害了股东的合法权益，股东有权通过合法途径维护自己的权益，如向公司董事会、监事会提出异议，或通过诉讼等方式解决纠纷。
三、刑事犯罪角度（需具体分析）
一般情况不构成犯罪：如前所述，公司法人拿走股东入股协议书不归还的行为，在一般情况下并不直接构成刑事犯罪。刑事犯罪通常要求行为具有严重的社会危害性，且违反刑法的具体规定。
特殊情况可能构成犯罪：若公司法人拿走协议书的目的是为了进行非法活动，如伪造、变造协议书以骗取财物或逃避债务等，且这些行为达到了刑法规定的犯罪标准，则可能构成相应的刑事犯罪，如诈骗罪、伪造公司、企业、事业单位、人民团体印章罪等。但这种情况需要具体分析行为动机、后果及协议内容等因素。
建议与措施
沟通协商：首先，建议股东与公司法人进行沟通协商，尝试通过友好方式解决问题。可以要求公司法人归还协议书或提供协议书的复印件等。
查阅公司章程与内部规定：若沟通协商无果，股东可以查阅公司章程或内部管理制度，了解协议书保管、使用等方面的规定，并据此采取相应的措施。
寻求法律帮助：若问题仍无法解决，股东可以寻求法律帮助，如咨询专业律师或向相关部门投诉举报等。律师可以根据具体情况提供法律意见或协助股东通过诉讼等方式维护自己的权益。
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