在刑事案件中，当事人突发疾病入院的费用，一般不由人民法院直接承担，而是根据具体情况由相关责任方或当事人自己承担，具体如下：
若当事人因被羁押期间突发疾病：
- 根据《中华人民共和国看守所条例》等相关规定，看守所应当对被羁押人进行健康检查，并建立病历档案。在羁押期间，被羁押人患病需要治疗的，看守所应当及时送医院治疗。此时，治疗费用一般由国家财政承担，即看守所的预算中会包含这部分费用，用于支付被羁押人在羁押期间因病治疗的相关费用。
- 但若疾病是由于当事人自身原因（如既往病史、不良生活习惯等）导致，且看守所已尽到合理的管理和照顾义务，那么治疗费用通常仍由国家承担。不过，如果当事人有经济能力，且其家属愿意承担，也可以由家属支付。
若当事人未被羁押，或虽被羁押但疾病与羁押无关：
- 在这种情况下，当事人突发疾病入院的治疗费用，一般应由当事人自己或其家属承担。如果当事人有医疗保险，可以按照医疗保险的规定进行报销。
- 如果疾病是由于第三方的过错或侵权行为导致，那么当事人有权向第三方追偿，要求其承担治疗费用。例如，如果当事人是在被他人伤害后入院治疗，那么伤害者应承担相应的医疗费用。
特殊情况下的费用承担：
- 如果当事人是贫困人口或符合其他社会救助条件，且疾病属于重大疾病或急需治疗的情况，那么当事人可以向当地的社会救助机构申请救助，以减轻经济负担。
- 在某些特殊情况下，如当事人因执行公务或参与社会公益活动而突发疾病，那么相关费用可能由单位或组织承担。但这种情况在刑事案件中较为少见。