公司是否可以将员工调至新门店，需根据具体情况来判断其合法性。以下从不同角度进行分析：
协商一致的情况：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括工作地点。因此，如果公司与员工就调至新门店的事宜进行了充分协商，并达成一致意见，且变更后的劳动合同以书面形式确认，那么这种调动是合法的。
公司单方面调动的情况：
- 如果公司未经员工同意，单方面决定将其调至新门店，这可能构成对劳动合同的变更，且未遵循法定程序。在这种情况下，员工有权拒绝调动，并可以依据相关法律法规维护自己的权益。例如，员工可以要求公司继续履行原劳动合同，或者如果因此导致劳动合同无法继续履行，员工可以要求公司支付经济补偿金。
特定情形下的调动：
- 在某些特定情况下，公司可能基于业务需要、员工能力匹配度等因素，对员工进行调动。然而，这种调动仍然需要遵循合法、合理、公平的原则，并且不能损害员工的合法权益。如果公司能够证明调动是出于正当的业务需求，并且已经采取了合理的措施来减轻对员工的影响（如提供交通补贴、调整工作时间等），那么这种调动可能被视为合法。但即便如此，公司也应与员工进行充分沟通，并尽量达成一致意见。
法律建议：
- 对于员工而言，如果面临公司单方面调动的情况，首先应与公司进行沟通，了解调动的原因和目的，并尝试协商达成一致意见。如果无法协商一致，员工可以依据相关法律法规维护自己的权益，如向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 对于公司而言，在调动员工时，应遵循合法、合理、公平的原则，并与员工进行充分沟通。如果调动是出于正当的业务需求，公司应提供必要的支持和补偿，以减轻对员工的影响。同时，公司也应确保调动不违反相关法律法规和劳动合同的约定。
可能后果：
- 如果公司未经员工同意单方面调动员工，且无法证明调动的合法性，员工有权拒绝调动并要求公司继续履行原劳动合同。如果公司因此解除劳动合同，员工可以要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。
- 如果员工因公司调动而遭受损失（如交通费用增加、生活不便等），员工可以要求公司进行相应的补偿。
总之，公司是否可以将员工调至新门店需根据具体情况来判断。在处理此类问题时，建议双方保持沟通并遵循相关法律法规的规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。