中标后转包，三年后被发现，应当向相关行政监督部门报告，具体处理机关及情况分析如下：
一般情况下的报告机关
- 根据《中华人民共和国招标投标法》第五十八条：“中标人将中标项目转让给他人的，将中标项目肢解后分别转让给他人的，违反本法规定将中标项目的部分主体、关键性工作分包给他人的，或者分包人再次分包的，转让、分包无效，处转让、分包项目金额千分之五以上千分之十以下的罚款；有违法所得的，并处没收违法所得；可以责令停业整顿；情节严重的，由工商行政管理机关吊销营业执照。”以及《中华人民共和国招标投标法实施条例》第七十六条：“中标人将中标项目转让给他人的，依照招标投标法第五十八条的规定处罚。”，中标后转包的行为，首先应当由有关行政监督部门（如发展改革部门、住房城乡建设部门、交通运输部门、水利部门等，具体取决于项目的性质和行业归属）进行查处。这些部门有权对转包行为进行调查、认定，并依法给予行政处罚。
涉及违法所得的处理
- 若转包行为中存在违法所得，根据上述法律规定，除了罚款外，有关行政监督部门还有权没收违法所得。这一处理措施旨在剥夺违法行为人的非法利益，维护市场秩序。
情节严重时的处理
- 若转包行为情节严重，如造成重大损失、影响恶劣等，除了上述行政处罚外，工商行政管理机关（现市场监督管理部门）还有权吊销中标人的营业执照。这是对违法行为人的一种严厉制裁，旨在彻底剥夺其从事相关经营活动的资格。
报告与举报的途径
- 在实际操作中，若发现中标后转包的行为，任何单位和个人都有权向有关行政监督部门进行举报。这些部门在接到举报后，应当依法进行调查处理，并将处理结果告知举报人。同时，中标人自身若意识到转包行为的违法性，也应当主动向相关行政监督部门报告，并配合调查处理，以减轻或避免可能的法律责任。
建议：中标后转包是违法行为，不仅可能面临行政处罚，还可能对中标人的声誉和长期发展造成严重影响。因此，建议中标人严格遵守法律法规，不得将中标项目转让给他人。若确实需要分包部分非主体、非关键性工作，应当依法进行，并确保分包人具备相应的资质和能力。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。