发现不能整改的问题，仍然可以下发纪检监察建议书并追究相关责任。以下从多个角度对此问题进行详细分析：

一、纪检监察建议书的性质与目的

纪检监察建议书是纪检监察机关在履行职责过程中，针对发现的问题向有关单位或个人提出的改进建议或要求。其目的在于促进问题的整改，防止类似问题再次发生，并推动相关单位或个人加强管理、完善制度。因此，即使问题本身不能立即整改或存在整改难度，纪检监察机关仍然有权根据问题的性质和严重程度，下发纪检监察建议书，要求相关单位或个人采取措施加以改进。

二、不能整改问题的处理方式

1. 明确问题性质与原因：

   • 在发现不能整改的问题时，首先要明确问题的性质、原因及可能产生的后果。这有助于纪检监察机关准确判断问题的严重程度，并据此制定合理的建议措施。

2. 提出改进建议：

   • 尽管问题可能无法立即整改，但纪检监察机关仍然可以提出改进建议，如加强管理、完善制度、加强培训等，以降低问题发生的可能性或减轻其后果。

3. 要求限期整改或说明情况：

   • 对于不能立即整改的问题，纪检监察机关可以要求相关单位或个人在规定期限内提出整改方案或说明情况。这有助于推动问题的逐步解决，并确保相关单位或个人对问题有足够的重视。

三、责任追究的依据与方式

1. 责任追究的依据：

   • 纪检监察机关在发现不能整改的问题时，如果认为相关单位或个人存在失职、渎职等行为，或者违反了相关法律法规、规章制度，那么就有权依据相关规定追究其责任。

2. 责任追究的方式：

   • 责任追究的方式可能包括警告、记过、降级、撤职、开除等行政处分，以及移送司法机关追究刑事责任等。具体方式应根据问题的性质、严重程度以及相关法律法规的规定来确定。

四、实际操作中的注意事项

1. 确保建议书的合法性与合理性：

   • 纪检监察机关在下发纪检监察建议书时，应确保建议书的合法性与合理性。建议书应明确指出问题的性质、原因、改进建议以及责任追究的依据和方式等，以便相关单位或个人能够准确理解并执行。

2. 加强沟通与协调：

   • 在处理不能整改的问题时，纪检监察机关应加强与相关单位或个人的沟通与协调。通过沟通了解问题的实际情况和困难，共同探讨解决方案，以推动问题的有效解决。

3. 持续跟踪与监督：

   • 纪检监察机关应对下发的纪检监察建议书进行持续跟踪与监督。确保相关单位或个人按照建议书的要求采取措施加以改进，并对整改情况进行定期检查和评估。

总结来说，发现不能整改的问题时，纪检监察机关仍然可以下发纪检监察建议书并追究相关责任。这有助于促进问题的整改和防止类似问题的再次发生。如果您在司法行政领域有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。