结论：合同中约定“干不满六个月扣半个月工资且扣上个月的工资”的条款，通常是违法的，该条款可能因违反法律法规的强制性规定而无效。以下从不同角度进行分析：
一、从劳动合同法的角度
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者约定劳动报酬时，应当遵循公平、合理、合法的原则，且不得违反法律、行政法规的强制性规定。具体来说：
工资扣除的合法性：
- 劳动合同法并未允许用人单位在劳动者未满一定服务期时扣除其工资作为违约金或惩罚。除非劳动者违反了与用人单位约定的服务期或竞业限制条款，并给用人单位造成了损失，用人单位才能要求劳动者承担赔偿责任，且赔偿金额通常有限制。
- 在您描述的情况下，合同中约定的“干不满六个月扣半个月工资且扣上个月的工资”显然不属于上述合法扣除的情形，因此该条款可能因违法而无效。
工资支付的保障：
- 劳动合同法规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。任何克扣或者无故拖欠劳动者工资的行为都是违法的。
- 合同中的该条款实际上是对劳动者工资的一种非法克扣，因此也是违法的。
二、从实际操作和法律后果的角度
实际操作中的问题：
- 即使合同中有这样的约定，用人单位在实际操作中也可能面临法律风险。因为劳动者有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求用人单位支付被扣除的工资。
- 一旦劳动监察部门或劳动仲裁机构认定该条款违法，用人单位将需要支付被扣除的工资，并可能面临罚款等法律责任。
法律后果：
- 如果用人单位依据该违法条款扣除了劳动者的工资，劳动者可以要求用人单位返还被扣除的工资，并可以要求用人单位支付赔偿金。
- 在极端情况下，如果用人单位的行为构成恶意拖欠工资，还可能面临刑事责任。
三、建议与行动
对于劳动者：
- 如果您的合同中有这样的条款，建议您与用人单位协商修改或删除该条款。
- 如果用人单位拒绝修改或删除，您可以向当地的劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
对于用人单位：
- 建议您重新审视合同中的相关条款，确保它们符合法律法规的规定。
- 避免设置违法或不合理条款，以减少法律风险和纠纷的发生。
最后，劳动合同是劳动者与用人单位之间的重要法律文件，双方都应当严格遵守其中的约定。如果合同中存在违法或不合理条款，双方都有权要求修改或删除。如果您在劳动合同方面遇到任何问题或困惑，欢迎直接向我咨询。