关于您提出的“店铺转让费能否要回来”的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况、合同条款以及相关法律法规来综合判断。以下是我为您提供的详细分析：
一、转让费的基本性质
转让费，又称顶手费，是前手承租人将其租赁的商铺或经营权转让给下一承租人时收取的费用。这笔费用通常包含了原承租人对商铺的装修投入、品牌价值、客户资源等无形资产的溢价。然而，转让费至今没有明确的法律依据，其有效性和退还问题主要依赖于双方签订的合同以及实际情况。
二、能否要回转让费的情况分析
合同中有明确约定：
- 如果双方在转让合同中明确约定了转让费的退还条件、方式等，那么当满足这些条件时，您有权要求对方按照合同约定退还转让费。
合同未明确约定，但存在法定解除情形：
- 如果合同中没有明确约定转让费的退还问题，但出现了法定解除合同的情形（如对方严重违约、欺诈、胁迫等），您可以在解除合同的同时，要求对方退还转让费。但需要注意的是，这需要您提供充分的证据来证明对方的违约行为或欺诈行为。
合同履行完毕，无解除情形：
- 如果合同已经履行完毕，且没有出现法定解除合同的情形，那么您通常无法要求对方退还转让费。因为转让费是您为了获得商铺或经营权而支付的对价，一旦合同履行完毕，这笔费用就成为了对方应得的收益。
特殊情况：如商铺无法办理相关证照：
- 以您提供的第一个案例为例，如果因为商铺的房屋性质（如“住改商”）导致无法办理营业执照等必要证照，且这一情况在合同签订时对方未明确告知您，那么您可能可以基于对方未履行告知义务或存在欺诈行为而要求解除合同并退还转让费。但这也需要您提供充分的证据来证明对方存在过错。
三、建议与注意事项
签订详细合同：
- 在签订转让合同时，务必详细约定转让费的金额、支付方式、退还条件等条款，以避免未来出现纠纷。
进行尽职调查：
- 在接手商铺前，务必对商铺的房屋性质、产权情况、是否能够办理相关证照等进行充分了解，以降低商业风险。
保留证据：
- 在合同履行过程中，务必保留好所有与转让相关的证据（如合同、收据、聊天记录等），以便在出现纠纷时能够提供有力的证明。
寻求法律帮助：
- 如果出现纠纷且无法协商解决，建议您及时寻求法律帮助，通过法律途径来维护自己的合法权益。
综上所述，店铺转让费能否要回来取决于多种因素，包括合同条款、实际情况以及相关法律法规等。因此，在处理这类问题时，建议您务必谨慎对待，并咨询专业律师的意见。